UV Resonance Raman Elucidation of the Terminal and Internal Peptide Bond Conformations of Crystalline and Solution Oligoglycines.
UV Resonance Raman Elucidation of the Terminal and Internal Peptide Bond Conformations of Crystalline and Solution Oligoglycines.
复制标题
DOI：
10.1021/jz900117u
复制
发表时间：
2010-11-30
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Asher SA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bykov SV;Asher SA
大分子的光谱研究通常试图根据不同分子片段的总贡献来解释测量的光谱。这是振动光谱学中局域模式近似的基础。在共振拉曼光谱的情况下，分子碎片的独立贡献既需要局域模样行为，也需要非耦合的电子跃迁。在这里，我们发现水相低聚糖的深紫外共振拉曼光谱显示了独立的多肽键分子碎片贡献，表明多肽键、电子跃迁和振动模式是解偶联的。我们利用这一结果来分别确定低聚甘氨酸的内部和倒数第二个肽键的构象分布。我们的数据表明，在水溶液中，低聚甘氨酸末端残基的构象与晶体中的构象(31-螺旋和β-链)相似，但分布更广，而内肽键的构象集中在31-螺旋的Ramachandran角附近。
Spectroscopic investigations of macromolecules generally attempt to interpret the measured spectra in terms of the summed contributions of the different molecular fragments. This is the basis of the local mode approximation in vibrational spectroscopy. In the case of resonance Raman spectroscopy independent contributions of molecular fragments require both a local mode-like behavior and the uncoupled electronic transitions. Here we show that the deep UV resonance Raman spectra of aqueous solution phase oligoglycines show independent peptide bond molecular fragment contributions indicating that peptide bonds electronic transitions and vibrational modes are uncoupled. We utilize this result to separately determine the conformational distributions of the internal and penultimate peptide bonds of oligoglycines. Our data indicate that in aqueous solution the oligoglycine terminal residues populate conformations similar to those found in crystals (31-helices and β-strands), but with a broader distribution, while the internal peptide bond conformations are centered around the 31-helix Ramachandran angles.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1107/s0567740869002482
发表时间：
1969-01-01
期刊：
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION B-STRUCTURAL CRYSTALLOGRAPHY AND CRYSTAL CHEMISTRY
影响因子：
--
作者：
PARTHASARATHY, R
通讯作者：
PARTHASARATHY, R
影响因子：
3.3
作者：
Mikhonin, AV;Asher, SA
通讯作者：
Asher, SA
影响因子：
15
作者：
Mix, G;Schweitzer-Stenner, R;Asher, SA
通讯作者：
Asher, SA
影响因子：
3.8
作者：
Wang, Y;Spiro, TG
通讯作者：
Spiro, TG