Concatenation cDNA sequencing for transcriptome analysis.
Concatenation cDNA sequencing for transcriptome analysis.
复制标题
用于转录组分析的串联 cDNA 测序。
DOI：
10.1016/j.crvi.2003.09.032
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发表时间：
2003
影响因子：
2
通讯作者：
Gibbs,RichardA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gunaratne,PreethiH;Wu,JiaQian;Garcia,AngelaM;Hulyk,Steven;Worley,KimC;Margolin,JudithF;Gibbs,RichardA
我们描述了一个高通量 cDNA 测序管道 (http://www.hgsc.bcm.tmc.edu/projects/cdna)，该管道是为了满足对大型 cDNA 集合快速测序的新兴需求而构建的。使用这种策略，cDNA 插入片段被纯化并通过串联连接成大分子。这些“伪 BAC”接受随机鸟枪测序，从而对池中的大多数 cDNA 插入片段进行测序。使用这个串联 cDNA 测序平台，我们向哺乳动物基因保藏中心 (MGC) 贡献了超过 13,000 个来自人类和小鼠的全长 cDNA 序列。 d'ADNc 的大型收藏品将快速推出。 Les inserts d'ADNcsont Purifiés and junctions par concatenation en de grandes moleculars.这是“pseudo-BAC”的缩写，它是插入重组的多数序列中的一个序列。使用串联的 ADNc 序列板，我们可以从哺乳动物基因库 (MGC) 中获得 13 000 个人类和鼠类 ADNc 克隆序列。
We describe a high-throughput cDNA sequencing pipeline (http://www. hgsc. bcm. tmc. edu/projects/cdna) built in response to the emerging need for rapid sequencing of large cDNA collections. Using this strategy cDNA inserts are purified and joined through concatenation into large molecules. These ‘pseudo-BACs’ are subjected to random shotgun sequencing whereby the majority of cDNA inserts in the pool are sequenced. Using this concatenation cDNA sequencing platform, we have contributed more than 13 000 full-length cDNA sequences from human and mouse to the Mammalian Gene Collection (MGC).Nous décrivons une chaı̂ne de séquençage à haut débit (http://www. hgsc. bcm. tmc. edu/projects/cdna/), construite en réponse au besoin émergent de séquençage rapide de grandes collections d'ADNc. Les inserts d'ADNc sont purifiés et joints par concaténation en de grandes molécules. Ces «pseudo-BAC» sont soumis au séquençage aléatoire qui permet de séquencer la majorité des inserts regroupés. En utilisant cette plate-forme de séquençage d'ADNc par concaténation, nous avons soumis plus de 13 000 séquences de clones d'ADNc humains et murins de pleine longueur à la Mammalian Gene Collection (MGC).
影响因子：
14.9
作者：
Butterfield, YSN;Marra, MA;Jones, SJM
通讯作者：
Jones, SJM
影响因子：
3.5
作者：
HENIKOFF, S
通讯作者：
HENIKOFF, S