ProDom and ProDom-CG: tools for protein domain analysis and whole genome comparisons
ProDom and ProDom-CG: tools for protein domain analysis and whole genome comparisons
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DOI：
10.1093/nar/28.1.267
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发表时间：
2000-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kahn, D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Corpet, F;Servant, F;Kahn, D
ProDom 包含从 SWISS-PROT 和 TrEMBL 序列数据库 (http://www.toulouse.inra.fr/prodom.html) 自动生成的所有蛋白质结构域家族，ProDom-CG 来自应用于完整基因组的类似结构域分析 (http://www.toulouse.inra.fr/prodomCG.html)。 ProDom 数据库及其服务器的最新改进包括：扩大规模以包含来自 TrEMBL 的序列、将 Pfam-A 条目添加到专家验证的家族集中、稳定登录号的分配、域家族的一致性指标、子家族的域排列以及 Pfam-A 的链接。
ProDom contains all protein domain families automatically generated from the SWISS-PROT and TrEMBL sequence databases (http://www.toulouse. inra.fr/prodom.html), ProDom-CG results from a similar domain analysis as applied to completed genomes (http://www.toulouse.inra.fr/prodomCG.html). Recent improvements to the ProDom database and its server include: scaling up to include sequences from TrEMBL, addition of Pfam-A entries to the set of expert validated families, assignment of stable accession numbers, consistency indicators for domain families,domain arrangements of sub-families and links to Pfam-A.