Context-dependent regulatory mechanism of the splicing factor hnRNP L.
Context-dependent regulatory mechanism of the splicing factor hnRNP L.
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DOI：
10.1016/j.molcel.2009.12.027
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发表时间：
2010-01-29
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Lynch KW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Motta-Mena LB;Heyd F;Lynch KW
剪接调节蛋白在与外显子和内含子结合时通常具有不同的活性。然而，不太清楚的是，除了位置之外的变量是否会影响活动。HnRNP L结合存在于CD 45可变外显子4和5两者中的基序以影响它们的配位阻遏。在这里，我们表明，在其直接抑制外显子4相反，hnRNP L抑制外显子5通过对抗相邻的剪接增强子的活性。在不存在增强子的情况下，hnRNP L出乎意料地激活外显子包含。由于外显子4和5侧翼的剪接位点是不同的，我们直接研究了不同剪接位点强度对hnRNP L功能机制的影响。值得注意的是，hnRNP L与外显子的结合抑制强剪接位点，但增强弱剪接位点。hnRNP L稳定snRNP结合的模型可以以由固有snRNP-底物亲和力确定的方式解释这两种效应。
Splicing regulatory proteins often have distinct activities when bound to exons versus introns. However, less clear is whether variables besides location can influence activity. HnRNP L binds to a motif present in both CD45 variable exons 4 and 5 to affect their coordinate repression. Here we show that, in contrast to its direct repression of exon 4, hnRNP L represses exon 5 by countering the activity of a neighboring splicing enhancer. In the absence of the enhancer hnRNP L unexpectedly activates exon inclusion. As the splice sites flanking exon 4 and 5 are distinct, we directly examined the effect of varying splice site strength on the mechanism of hnRNP L function. Remarkably, binding of hnRNP L to an exon represses strong splice sites but enhances weak splice sites. A model in which hnRNP L stabilizes snRNP binding can explain both effects in a manner determined by the inherent snRNP-substrate affinity.
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