Epigenome-wide association study of chronic obstructive pulmonary disease and lung function in Koreans.
Epigenome-wide association study of chronic obstructive pulmonary disease and lung function in Koreans.
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DOI：
10.2217/epi-2017-0002
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发表时间：
2017-07
期刊：
影响因子：
3.8
通讯作者：
London SJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lee MK;Hong Y;Kim SY;Kim WJ;London SJ
鉴定与慢性阻塞性肺疾病 (COPD) 和肺功能特征相关的差异甲基化探针 (DMP) 和区域 (DMR)。我们使用 Infinium HumanMmethylation450（n = 100，韩国 COPD 队列）对血液 DNA 中的 COPD 和肺活量参数（包括 1 秒用力呼气量 (FEV1)、用力肺活量 (FVC) 和 FEV1/FVC）进行了全表观基因组关联研究。经过多重测试校正后，我们发现了 1 个显着的 DMP（cg03559389，DIP2C）和 104 个显着的 DMR。其中，34 个 DMR 映射到同一性状差异表达的基因。其中五个基因与两个以上性状相关：CTU2、USP36、ZNF516、KLK10 和 CPT1B。我们在韩国人血液 DNA 中发现了与 COPD 和肺功能相关的新差异甲基化位点，并证实了之前在非亚洲人中的发现。表观遗传修饰可能有助于这些表型的病因学。
To identify differentially methylated probes (DMPs) and regions (DMRs) in relation to chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and lung function traits. We performed an epigenome-wide association study of COPD and spirometric parameters, including forced expiratory volume in 1 s (FEV1), forced vital capacity (FVC) and FEV1/FVC, in blood DNA using the Infinium HumanMethylation450 (n = 100, a Korean COPD cohort). We found one significant DMP (cg03559389, DIP2C) and 104 significant DMRs after multiple-testing correction. Of these, 34 DMRs mapped to genes differential expressed with respect to the same trait. Five of the genes were associated with more than two traits: CTU2, USP36, ZNF516, KLK10 and CPT1B. We identified novel differential methylation loci related to COPD and lung function in blood DNA in Koreans and confirmed previous findings in non-Asians. Epigenetic modification could contribute to the etiology of these phenotypes.
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影响因子：
3.5
作者：
Cho, Michael H.;Castaldi, Peter J.;Silverman, Edwin K.
通讯作者：
Silverman, Edwin K.
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
影响因子：
5.8
作者：
BENJAMINI, Y;HOCHBERG, Y
通讯作者：
HOCHBERG, Y
影响因子：
10
作者：
Jackson VE;Ntalla I;Sayers I;Morris R;Whincup P;Casas JP;Amuzu A;Choi M;Dale C;Kumari M;Engmann J;Kalsheker N;Chappell S;Guetta-Baranes T;McKeever TM;Palmer CN;Tavendale R;Holloway JW;Sayer AA;Dennison EM;Cooper C;Bafadhel M;Barker B;Brightling C;Bolton CE;John ME;Parker SG;Moffat MF;Wardlaw AJ;Connolly MJ;Porteous DJ;Smith BH;Padmanabhan S;Hocking L;Stirrups KE;Deloukas P;Strachan DP;Hall IP;Tobin MD;Wain LV
通讯作者：
Wain LV
影响因子：
5.8
作者：
Busch R;Qiu W;Lasky-Su J;Morrow J;Criner G;DeMeo D
通讯作者：
DeMeo D
影响因子：
2.9
作者：
Kim WJ;Lim JH;Lee JS;Lee SD;Kim JH;Oh YM
通讯作者：
Oh YM