The Disease and Gene Annotations (DGA): an annotation resource for human disease.
The Disease and Gene Annotations (DGA): an annotation resource for human disease.
复制标题
疾病和基因注释（DGA）：人类疾病的注释资源
DOI：
10.1093/nar/gks1244
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发表时间：
2013-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Xia T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Peng K;Xu W;Zheng J;Huang K;Wang H;Tong J;Lin Z;Liu J;Cheng W;Fu D;Du P;Kibbe WA;Lin SM;Xia T
疾病和基因注释数据库（DGA，http://dga.nubic.northwestern.edu）是一个协作努力，旨在通过整合疾病本体（DO第3版修订2510，其具有8043种遗传性、发育性和获得性人类疾病）、NCBI基因功能参考（GeneRIF）和分子相互作用网络（MIN）的可计算控制词汇表，在疾病网络背景下提供人类基因的全面和综合注释。DGA使用语义映射将这些资源整合在一起，以基于当前知识建立具有良好覆盖率的疾病-基因和基因-基因关系的综合集合。DGA通过定期重新解析DO、GeneRIF和MIN来保持最新。DGA提供了一个用户友好和互动的网络界面系统，使用户能够有效地查询，下载和可视化的DO树结构和注释作为树，网络图或列表。为了促进综合分析，DGA提供了一个Web服务应用程序编程接口，用于与外部分析工具集成。
Disease and Gene Annotations database (DGA, http://dga.nubic.northwestern.edu) is a collaborative effort aiming to provide a comprehensive and integrative annotation of the human genes in disease network context by integrating computable controlled vocabulary of the Disease Ontology (DO version 3 revision 2510, which has 8043 inherited, developmental and acquired human diseases), NCBI Gene Reference Into Function (GeneRIF) and molecular interaction network (MIN). DGA integrates these resources together using semantic mappings to build an integrative set of disease-to-gene and gene-to-gene relationships with excellent coverage based on current knowledge. DGA is kept current by periodically reparsing DO, GeneRIF, and MINs. DGA provides a user-friendly and interactive web interface system enabling users to efficiently query, download and visualize the DO tree structure and annotations as a tree, a network graph or a tabular list. To facilitate integrative analysis, DGA provides a web service Application Programming Interface for integration with external analytic tools.
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作者：
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