H3.3 actively marks enhancers and primes gene transcription via opening higher-ordered chromatin.
H3.3 actively marks enhancers and primes gene transcription via opening higher-ordered chromatin.
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H3.3 通过打开高阶染色质主动标记增强子并启动基因转录
DOI：
10.1101/gad.222174.113
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发表时间：
2013-10-01
影响因子：
10.5
通讯作者：
Li G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chen P;Zhao J;Wang Y;Wang M;Long H;Liang D;Huang L;Wen Z;Li W;Li X;Feng H;Zhao H;Zhu P;Li M;Wang QF;Li G
在这项研究中，陈等人发现组蛋白变体H3.3会损害高阶染色质折叠并促进基因激活。H3.3积极标记增强子，并通过产生一种开放的染色质特征来决定维甲酸（RA）调控基因的转录潜能，这种特征使维甲酸受体/类视黄醇X受体（RAR/RXR）能够结合。维甲酸诱导导致H3.3结合到启动子区域，通过抵消H2A.Z介导的染色质压缩来激活转录。
组蛋白变体H3.3和H2A.Z最近已成为转录调控中两个最重要的特征，但其分子机制仍知之甚少。在这项研究中，我们研究了转录激活过程中H3.3和H2A.Z对染色质动力学的调控。我们的体外生物物理和生物化学研究表明，H2A.Z促进染色质压缩并抑制转录活性。令人惊讶的是，尽管H3.3与标准H3仅有4到5个氨基酸的差异，但它极大地损害了高阶染色质折叠并促进基因激活，尽管它对单核小体的稳定性没有显著影响。我们进一步证明，H3.3积极标记增强子，并通过产生一种开放的染色质特征来决定维甲酸（RA）调控基因的转录潜能，这种特征使RAR/RXR能够结合。此外，H3.3依赖的H2A.Z在启动子区域的募集导致染色质压缩以准备转录，而维甲酸诱导导致H3.3结合到启动子区域，通过抵消H2A.Z介导的染色质压缩来激活转录。我们的研究结果为组蛋白变体H3.3和H2A.Z如何通过调节增强子和启动子区域的染色质动力学共同调控基因转录的机制提供了关键见解。
In this study, Chen et al. discover that the histone variant H3.3 impairs higher-ordered chromatin folding and promotes gene activation. H3.3 actively marks enhancers and determines the transcriptional potential of retinoid acid (RA)-regulated genes via creating an open chromatin signature that enables the binding of RAR/RXR. RA induction results in the incorporation of H3.3 on promoter regions to activate transcription via counteracting H2A.Z-mediated chromatin compaction.
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影响因子：
64.5
作者：
Goldberg AD;Banaszynski LA;Noh KM;Lewis PW;Elsaesser SJ;Stadler S;Dewell S;Law M;Guo X;Li X;Wen D;Chapgier A;DeKelver RC;Miller JC;Lee YL;Boydston EA;Holmes MC;Gregory PD;Greally JM;Rafii S;Yang C;Scambler PJ;Garrick D;Gibbons RJ;Higgs DR;Cristea IM;Urnov FD;Zheng D;Allis CD
通讯作者：
Allis CD
影响因子：
16
作者：
John, Sam;Sabo, Peter J.;Hager, Gordon L.
通讯作者：
Hager, Gordon L.
EZH1和EZH2通过不同的机制保持抑制性染色质。
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作者：
Margueron, Raphael;Li, Guohong;Sarma, Kavitha;Blais, Alexandre;Zavadil, Jiri;Woodcock, Christopher L.;Dyniacht, Brian D.;Reinberg, Danny
通讯作者：
Reinberg, Danny
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10.5
作者：
Khodor, Yevgenia L.;Rodriguez, Joseph;Rosbash, Michael
通讯作者：
Rosbash, Michael
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp698
发表时间：
2010-03-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Li H;Durbin R
通讯作者：
Durbin R