Using the MetaCyc pathway database and the BioCyc database collection.
Using the MetaCyc pathway database and the BioCyc database collection.
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使用MetaCyc途径数据库和BioCyc数据库集合。
DOI：
10.1002/0471250953.bi0117s20
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发表时间：
2007
影响因子：
--
通讯作者：
Karp,PeterD
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Caspi,Ron;Karp,PeterD
MetaCyc数据库（http：metacyc.org）是来自各种生物体的一千多种代谢途径的集合，通过人工整理从文献中收集。BioCyc包含370多个途径/基因组数据库，每个数据库都描述了单个生物体的基因组和预测的代谢途径，如使用MetaCyc数据作为参考，从注释的基因组中计算预测的那样。本单元中的协议向用户介绍MetaCyc和BioCyc中可用的广泛数据内容，以及使用Pathway Tools软件查询，可视化和分析这些数据的机制。协议生物信息。20：1.17.1 - 1.17.51.© 2007年由约翰威利父子公司。
The MetaCyc database (http://metacyc.org) is a collection of more than a thousand metabolic pathways from a wide variety of organisms, collected from the literature by manual curation. BioCyc contains more than 370 Pathway/Genome Databases, each of which describes the genome and predicted metabolic pathways of a single organism, as computationally predicted from the annotated genomes, using MetaCyc data as a reference. The protocols in this unit introduce the user to the extensive data content available in MetaCyc and BioCyc, and to mechanisms for querying, visualizing, and analyzing these data using the Pathway Tools software.Curr. Protoc. Bioinform. 20:1.17.1‐1.17.51. © 2007 by John Wiley & Sons, Inc.