Analysis of conformational changes in rhodopsin by histidine hydrogen-deuterium exchange.
Analysis of conformational changes in rhodopsin by histidine hydrogen-deuterium exchange.
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通过组氨酸氢-氘交换分析视紫红质的构象变化。
DOI：
10.1007/978-1-4939-2330-4_9
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发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Miyagi,Masaru
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lodowski,DavidT;Miyagi,Masaru
氢-氘交换（HDX）是一种测量蛋白质氢与含D2 O缓冲液中氘的交换的技术，提供结构动力学的读数。组氨酸氢-氘交换质谱（His-HDX-MS）是该技术的一种变体，可测量组氨酸咪唑C2氢的慢HDX。当伴随pH滴定时，该测量可提供蛋白质中单个组氨酸残基的HDX反应的pKa和半衰期（t1/2）。pKaandt 1/2值分别表示组氨酸残基的静电环境和侧链溶剂可及性程度。在这里，我们描述了一个实验方案，以表征视紫红质的His-HDX-MS。这种技术可以用来监测不同状态的视紫红质，并可能是有用的监测长期规模的事件，在其他GPCR。
Hydrogen–deuterium exchange (HDX) is a technique that measures the exchange of protein hydrogens for deuteriums in a D2O-containing buffer, providing readout of the structural dynamics. Histidine hydrogen–deuterium exchange mass spectrometry (His-HDX-MS) is a variation of this technique that measures the slow HDX of imidazole C2hydrogens of histidines. This measurement, when accompanied by pH titration, provides both pKas and half-lives (t1/2) of the HDX reaction for individual histidine residues in proteins. The pKaandt1/2values indicate the electrostatic environment and the degree of side-chain solvent accessibility of the histidine residues, respectively. Herein we describe an experimental protocol to characterize rhodopsin by His-HDX-MS. This technique can be used to monitor different states of rhodopsin and might be useful for monitoring longtime scale events in other GPCRs.
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影响因子：
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作者：
C. Hirs
通讯作者：
C. Hirs
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作者：
Miyagi, Masaru;Nakazawa, Takashi
通讯作者：
Nakazawa, Takashi
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作者：
Amyes, TL;Diver, ST;Toth, K
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Toth, K
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作者：
Lodowski, David T.;Palczewski, Krzysztof;Miyagi, Masaru
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Miyagi, Masaru
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Mullangi V;Zhou X;Ball DW;Anderson DJ;Miyagi M
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Miyagi M