Complete mitochondrial genome of the Rhus gall aphid Schlechtendalia chinensis (Hemiptera: Aphididae: Eriosomatinae).
Complete mitochondrial genome of the Rhus gall aphid Schlechtendalia chinensis (Hemiptera: Aphididae: Eriosomatinae).
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DOI：
10.1080/23802359.2016.1241678
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发表时间：
2016-11-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wen J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ren ZM;Bai X;Harris AJ;Wen J
我们测序了第一个完整的线粒体基因组的蚜虫亚科，Eriosomatinae，从一个盐肤木倍蚜，Schlechtendalia chinensis。S.该基因全长16, 047 bp，A + T含量高达84.2%，由13个蛋白质编码基因、24个tRNA基因（包括两个额外的tRNAPhe）、两个rRNA基因、一个重复区和一个控制区组成。所有蛋白质编码基因都有一个典型的ATN起始密码子和TAA终止密码子，只有COI和ND 4以一个T终止。所有24个tRNA都具有预期的三叶草二级结构，大小范围从62到73 bp。rrnL和rrnS基因的长度分别为1274和772 bp。重复区域为335 bp，并且在以tRNAPhe开始的已知蚜虫序列中是不常见的。控制区长705 bp，位于rrnS和tRNAIle之间。我们提出了一个有丝分裂基因组的同源性表明，S。chinensis是Aphidinae的姐妹。
We sequenced the first complete mitochondrial genome for the aphid subfamily, Eriosomatinae, from a Rhus gall aphid, Schlechtendalia chinensis. The mitogenome of S. chinensis is 16,047 bp in length with a high A + T content of 84.2% and consists of 13 protein-coding genes, 24 tRNA genes including two extra tRNAPhe, two rRNA genes, a repeat region, and a control region. All protein-coding genes have a typical ATN initiation codon and TAA termination codon except COI and ND4, which terminate with a single T. All 24 tRNAs have the expected clover-leaf secondary structure and range in size from 62 to 73 bp. The lengths of rrnL and rrnS genes are 1274 and 772 bp, respectively. The repeat region is 335 bp and is uncommon among known aphid sequences for starting with a tRNAPhe. The control region is 705 bp in length and is located between rrnS and tRNAIle. We present a phylogeny of mitogenomes showing that S. chinensis is sister to Aphidinae.
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