Molecular taxonomy: description of a cryptic Petitia species (Polychaeta: Syllidae) from the island of Mahé (Seychelles, Indian Ocean) using RAPD markers and ITS2 sequences
Molecular taxonomy: description of a cryptic Petitia species (Polychaeta: Syllidae) from the island of Mahé (Seychelles, Indian Ocean) using RAPD markers and ITS2 sequences
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分子分类学：使用 RAPD 标记和 ITS2 序列描述来自马埃岛（塞舌尔，印度洋）的一种神秘 Petitia 物种（多毛类：Syllidae）
DOI：
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发表时间：
2001
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Hass‐Cordes
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Westheide;Hass‐Cordes
隐小蜂，新种提供了一个例子，证明了一个形态上无法区分的物种分类单元可以单独通过分子标记来描述。表型多毛类属于Petitia amphophthalma Siewing，1956年，众多小型底栖动物物种之一，以前被认为是世界性的。然而，通过随机扩增多态性DNA（RAPD）-聚合酶链反应（PCR）（DNA指纹技术）的人口在印度-太平洋岛屿的马埃岛可以确定为一个独特的分类实体：（1）遗传距离值之间的Petitia从塞舌尔和其他网站（地中海，加那利群岛）是相对较大的;（2）不同产生的聚类分析的遗传距离产生表现揭示一个明显独立的分支（bootstrap 100%）;和（3）塞舌尔动物的特征在于8个单形诊断（即自形）DNA片段。在这种情况下，RAPD程序需要制备整个生物体，因此没有正模。相反，保存的是用六个引物获得的一个个体的诊断标记的RAPD带型、一个个体的分离DNA以及固定、完整个体形式的综合型。通过基因组DNA测序（ITS 2）确认物种分化。
分子分类：利用RAPD标记和ITS 2测序技术对Insel马埃岛（Seychellen，Indischer Ozean）的一种隐孢子虫进行研究
隐小蜂Petitia occulta sp.n.例如，一个形态学上没有区别的分类单元是由分子标记分类学上的韦尔登组成的。1956年，一种小型底栖动物，一种在沙漠中被广泛使用的世界政治宣传工具，一种小型底栖动物，一种被广泛使用的小型底栖动物，一种被广泛使用的小型底栖动物。应用RAPD-PCR-指纹技术对马埃岛小种群体进行基因分型的最新研究结果表明：（1）遗传距离在印度小种和野生小种中的分布（Mittelmeer，Kanjuche Inseln）sind relativ prone;（2）通过遗传距离的非线性分析，（3）8种特异性DNA片段的分离、诊断及个体差异性DNA片段特征。在RAPD-PCR技术的基础上，还需要一个完整的组织准备工作，这不是一个完整的测试。这些DNA片段将通过DNA片段收集器和诊断试剂盒收集到一个个体中，这些DNA片段将被收集到一个博物馆中的一个个体的乙醇中和一个个体的合成型中。Schlieslich将通过对基因组DNA（ITS 2）进行测序来确定新的技术。
Petitia occulta sp. n. provides an example demonstrating that a morphologically indistinguishable species taxon can be described by molecular markers alone. Phenotypically the polychaete belongs to Petitia amphophthalma Siewing, 1956, one of the numerous meiofaunal species that have previously been regarded as cosmopolitan. Genotypically, however, by means of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)–polymerase chain reaction (PCR) (a DNA-fingerprinting technique) the population on the Indo-Pacific island of Mahe can be identified as a distinct taxonomic entity as: (1) genetic distance values between the Petitia from the Seychelles and from other sites (Mediterranean, Canary Islands) are relatively great; (2) differently generated cluster analyses of genetic distances produce phenograms revealing a distinctly separate clade (bootstrap 100%) for the Seychelles animals; and (3) the Seychelles animals are characterized by eight monomorphic diagnostic (i.e. autapomorphic) DNA-fragments. The RAPD procedure in this case requires the preparation of the whole organisms and, thus, no holotype is available. Instead the RAPD band-pattern with the diagnostic markers of one individual obtained with six primers, isolated DNA of one individual, and syntypes in the form of fixed, complete individuals are deposited. Species differentiation is confirmed by genomic DNA sequencing (ITS2).
Molekulare Taxonomie: Beschreibung einer kryptischen Petitia-Art (Polychaeta: Syllidae) von der Insel Mahe (Seychellen, Indischer Ozean) aufgrund von RAPD-Markern und ITS2-Sequenzen
Mit der vorliegenden Beschreibung von Petitia occulta sp.n. wird exemplarisch gezeigt, das ein morphologisch nicht differenzierbares Art-Taxon allein aufgrund molekularer Marker taxonomisch verfugbar gemacht werden kann. Phanotypisch gehort der winzige Polychaet zu Petitia amphophthalma Siewing 1956, eine der zahlreichen Meiofauna-Arten, fur die bisher eine kosmopolitische Verbreitung in Sandstranden angenommen wurde. Genotypisch last sich dagegen mit der RAPD-PCR-fingerprinting-Technik die Petitia-Population auf der Seychellen-Insel Mahe als eigene taxonomische Einheit erkennen: (1) die genetischen Distanzen zwischen den Tieren im Indopazifik und den Petitia anderer Fundorte (Mittelmeer, Kanarische Inseln) sind relativ gros; (2) mit unterschiedlichen Algorithmen erstellte Clusteranalysen der genetischen Distanzen liefern alle einen deutlich getrennten (Bootstrapwerte 100%) Cladus fur die indopazifischen Tiere; (3) schlieslich sind letztere durch 8 spezifische, diagnostische – also bei allen Individuen vorkommende und daher autapomorphe – DNA-Fragmente charakterisiert. Da bei der RAPD-PCR dieser sehr kleinen Tiere eine Praparation der gesamten Organismen notwendig ist, steht kein Holotyp zur Verfugung. Dies wird ausgeglichen durch die Hinterlegung eines DNA-Fragmentmusters mit den diagnostischen Banden eines Individuums, die von sechs der verwendeten Primer stammen, isolierter DNA eines Individuums in Ethanol und von Syntypen in Form fixierter vollstandiger Individuen in einem Museum. Schlieslich wird die neue Art bestatigt und belegt durch diskriminierende Sequenzen genomischer DNA (ITS2).