The ChEMBL Database in 2023: a drug discovery platform spanning multiple bioactivity data types and time periods.
The ChEMBL Database in 2023: a drug discovery platform spanning multiple bioactivity data types and time periods.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkad1004
复制
发表时间：
2024-01-05
影响因子：
14.9
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
ChEMBL （https://www.ebi.ac.uk/chembl/）是一个人工整理的、高质量的、大规模的、开放的、公平的、全球核心的具有药物性质的生物活性分子生物数据资源，之前在2012年、2014年、2017年和2019年的《核酸研究数据库问题》中有描述。自2009年推出以来，ChEMBL的内容在数据类型的大小和多样性方面发生了巨大变化。自2019年更新以来，通过整合来自存款人的多个新数据集，ChEMBL现在包含的来自存储数据的生物活性数据比从文献中提取的数据略多。与EUbOPEN联盟合作，化学探针数据现在定期存入ChEMBL。第27版为从几个大规模药物再利用筛选中筛选潜在抗sars - cov -2活性的化合物提供了精心整理的数据。此外，新的专利生物活性数据已添加到最新的ChEMBL版本中，并纳入了各种新功能，包括天然产品相似性评分，天然产品的更新标志，化学探针的新标志，以及用于~ 270,000生物活性测量的作用类型的初始注释。
ChEMBL (https://www.ebi.ac.uk/chembl/) is a manually curated, high-quality, large-scale, open, FAIR and Global Core Biodata Resource of bioactive molecules with drug-like properties, previously described in the 2012, 2014, 2017 and 2019 Nucleic Acids Research Database Issues. Since its introduction in 2009, ChEMBL’s content has changed dramatically in size and diversity of data types. Through incorporation of multiple new datasets from depositors since the 2019 update, ChEMBL now contains slightly more bioactivity data from deposited data vs data extracted from literature. In collaboration with the EUbOPEN consortium, chemical probe data is now regularly deposited into ChEMBL. Release 27 made curated data available for compounds screened for potential anti-SARS-CoV-2 activity from several large-scale drug repurposing screens. In addition, new patent bioactivity data have been added to the latest ChEMBL releases, and various new features have been incorporated, including a Natural Product likeness score, updated flags for Natural Products, a new flag for Chemical Probes, and the initial annotation of the action type for ∼270 000 bioactivity measurements.
登录
查看更多内容
影响因子：
2.7
作者：
Magariños MP;Gaulton A;Félix E;Kiziloren T;Arcila R;Oprea TI;Leach AR
通讯作者：
Leach AR
影响因子：
4
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
4.6
作者：
Morger, Andrea;de Lomana, Marina Garcia;Norinder, Ulf;Svensson, Fredrik;Kirchmair, Johannes;Mathea, Miriam;Volkamer, Andrea
通讯作者：
Volkamer, Andrea
影响因子：
5.6
作者：
Ertl, Peter;Roggo, Silvio;Schuffenhauer, Ansgar
通讯作者：
Schuffenhauer, Ansgar
影响因子：
64.5
作者：
Bouhaddou, Mehdi;Memon, Danish;Krogan, Nevan J.
通讯作者：
Krogan, Nevan J.