Detection of alternative splicing of fibronectin mRNA in a single cell.
Detection of alternative splicing of fibronectin mRNA in a single cell.
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检测单个细胞中纤连蛋白 mRNA 的选择性剪接。
作者：
T. Kumazaki;Y. Mitsui;K. Hamada;H. Sumida;M. Nishiyama
前纤连蛋白mRNA在EDA、EDB和IIICS三个位点进行选择性剪接。我们分析了单个细胞中纤连蛋白mRNA的选择性剪接。逆转录-聚合酶链反应分析显示，在这些位点中的每一个产生单一形式的mRNA的细胞以及在给定位点产生多种形式的细胞：例如，一些细胞产生EDA（+）或EDA（-）形式的mRNA，而其他细胞产生两种形式。约80%的细胞在EDA和EDB位点产生（+）和（-）形式的mRNA，其余细胞含有（+）或（-）形式。五种形式的纤连蛋白mRNA可以导致在IIICS网站的选择性剪接。在单个细胞中观察到复杂的可变剪接产物组合：相对于IIICS位点，有10种不同的mRNA亚型组合。在细胞衰老过程中，观察到IIICS位点的可变剪接发生统计学显著变化。
Pre-fibronectin mRNA is subject to alternative splicing at three sites, EDA, EDB and IIICS. We analyzed the alternative splicing of fibronectin mRNA in a single cell. Reverse transcription-polymerase chain reaction analyses showed cells that produced a single form of mRNA at each one of these sites as well as cells that produced multiple forms at a given site: for example, some cells produced either the EDA(+) or EDA(-) form of the mRNA and other cells produced both forms. About 80% of the cells produced both (+) and (-) forms of the mRNA at the EDA and EDB sites, and the remaining cells contained either the (+) or (-) form. Five forms of fibronectin mRNA can result from alternative splicing at the IIICS site. Complex combinations of alternative splicing products were observed among the individual cells: there were ten different combinations of mRNA isoforms with respect to the IIICS site. Statistically significant changes in alternative splicing at the IIICS site were observed during cellular senescence.
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