Complex model calibration through emulation, a worked example for a stochastic epidemic model.
Complex model calibration through emulation, a worked example for a stochastic epidemic model.
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DOI：
10.1016/j.epidem.2022.100574
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发表时间：
2022-06
期刊：
影响因子：
3.8
通讯作者：
Swallow, Ben
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dunne, Michael;Mohammadi, Hossein;Challenor, Peter;Borgo, Rita;Porphyre, Thibaud;Vernon, Ian;Firat, Elif E.;Turkay, Cagatay;Torsney-Weir, Thomas;Goldstein, Michael;Reeve, Richard;Fang, Hui;Swallow, Ben
不确定性量化是统计估计的正式范式，旨在解释现实世界复杂系统建模过程中固有的所有不确定性。这些方法直接适用于流行病学中的随机模型，但它们迄今尚未在此背景下广泛使用。在本文中，我们提供了一个教程的不确定性量化的随机流行病模型，旨在促进使用的不确定性量化范式的从业者与其他复杂的随机模拟器的应用系统。我们提供了一个正式的工作流程，包括需要采取的重要决策和考虑，并说明了一个简单的随机流行病模型的方法，英国SARS-CoV-2的传播和患者的结果。我们还提出了新的方法来可视化输出的敏感性分析和不确定性量化更普遍的高输入和/或输出尺寸。
Uncertainty quantification is a formal paradigm of statistical estimation that aims to account for all uncertainties inherent in the modelling process of real-world complex systems. The methods are directly applicable to stochastic models in epidemiology, however they have thus far not been widely used in this context. In this paper, we provide a tutorial on uncertainty quantification of stochastic epidemic models, aiming to facilitate the use of the uncertainty quantification paradigm for practitioners with other complex stochastic simulators of applied systems. We provide a formal workflow including the important decisions and considerations that need to be taken, and illustrate the methods over a simple stochastic epidemic model of UK SARS-CoV-2 transmission and patient outcome. We also present new approaches to visualisation of outputs from sensitivity analyses and uncertainty quantification more generally in high input and/or output dimensions.
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DOI：
10.1109/tvcg.2012.110
发表时间：
2013-03-01
影响因子：
5.2
作者：
Kehrer, Johannes;Hauser, Helwig
通讯作者：
Hauser, Helwig
DOI：
10.1109/tvcg.2019.2944182
发表时间：
2021-03-01
影响因子：
5.2
作者：
Espadoto, Mateus;Martins, Rafael M.;Telea, Alexandru C.
通讯作者：
Telea, Alexandru C.
影响因子：
4.3
作者：
Andrianakis I;Vernon IR;McCreesh N;McKinley TJ;Oakley JE;Nsubuga RN;Goldstein M;White RG
通讯作者：
White RG
DOI：
10.1109/tvcg.2013.61
发表时间：
2013-09-01
影响因子：
5.2
作者：
Bergner, Steven;Sedlmair, Michael;Saad, Ahmed
通讯作者：
Saad, Ahmed
影响因子：
1.7
作者：
Kamal, Aasim;Dhakal, Parashar;Marinier, Robert
通讯作者：
Marinier, Robert