Nmrglue: an open source Python package for the analysis of multidimensional NMR data.
Nmrglue: an open source Python package for the analysis of multidimensional NMR data.
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DOI：
10.1007/s10858-013-9718-x
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发表时间：
2013-04
影响因子：
2.7
通讯作者：
Jaroniec CP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Helmus JJ;Jaroniec CP
本文介绍了Nmrglue，这是一个用于处理多维核磁共振（NMR）数据的开源Python软件包。当与其他Python科学库结合使用时，Nmrglue为光谱处理、分析和可视化提供了一个高度灵活且强大的环境，并包含许多常见的工具，如线性预测、峰选取和线形拟合。该软件包还能使现有的NMR软件程序很容易地结合在一起，目前便于读取、写入和转换存储在布鲁克（Bruker）、安捷伦/瓦里安（Agilent/Varian）、NMRPipe、Sparky、SIMPSON和罗兰NMR工具包（Rowland NMR Toolkit）文件格式中的数据。除了标准应用外，Nmrglue所提供的多功能性使其特别适用于以下任务：处理原始光谱仪数据文件，对具有不规则线形的多维NMR光谱进行自动化定量分析（例如在生物大分子固态NMR中经常遇到的情况），以及快速实现和开发非常规的数据处理方法，如协方差NMR和其他非傅里叶方法。Nmrglue的详细文档、安装文件和源代码可在http://nmrglue.com免费获取。源代码可根据新BSD许可证重新分发和修改。
Nmrglue, an open source Python package for working with multidimensional NMR data, is described. When used in combination with other Python scientific libraries, nmrglue provides a highly flexible and robust environment for spectral processing, analysis and visualization and includes a number of common utilities such as linear prediction, peak picking and lineshape fitting. The package also enables existing NMR software programs to be readily tied together, currently facilitating the reading, writing and conversion of data stored in Bruker, Agilent/Varian, NMRPipe, Sparky, SIMPSON, and Rowland NMR Toolkit file formats. In addition to standard applications, the versatility offered by nmrglue makes the package particularly suitable for tasks that include manipulating raw spectrometer data files, automated quantitative analysis of multidimensional NMR spectra with irregular lineshapes such as those frequently encountered in the context of biomacromolecular solid-state NMR, and rapid implementation and development of unconventional data processing methods such as covariance NMR and other non-Fourier approaches. Detailed documentation, install files and source code for nmrglue are freely available at http://nmrglue.com. The source code can be redistributed and modified under the New BSD license.
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影响因子：
3.5
作者：
Gorgolewski K;Burns CD;Madison C;Clark D;Halchenko YO;Waskom ML;Ghosh SS
通讯作者：
Ghosh SS
Biopython：用于计算分子生物学和生物信息学的免费 Python 工具。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp163
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Cock PJ;Antao T;Chang JT;Chapman BA;Cox CJ;Dalke A;Friedberg I;Hamelryck T;Kauff F;Wilczynski B;de Hoon MJ
通讯作者：
de Hoon MJ
影响因子：
15
作者：
Helmus, Jonathan J.;Surewicz, Krystyna;Apostol, Marcin I.;Surewicz, Witold K.;Jaroniec, Christopher P.
通讯作者：
Jaroniec, Christopher P.
DOI：
10.1002/mrc.2526
发表时间：
2009-12
期刊：
Magnetic resonance in chemistry : MRC
影响因子：
--
作者：
Lewis IA;Schommer SC;Markley JL
通讯作者：
Markley JL
影响因子：
2.2
作者：
Bak, M;Rasmussen, JT;Nielsen, NC
通讯作者：
Nielsen, NC