小桐子JcMAPK3基因的克隆及低温表达分析
小桐子JcMAPK3基因的克隆及低温表达分析
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DOI：
10.16213/j.cnki.scjas.2020.11.006
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
龚明
中科院分区：
文献类型：
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作者：
杨宇;陈永坤;孔春艳;龚明
【目的】低温严重影响着能源植物小桐子的生长发育及桐油产量,对小桐子抗冷性相关基因的挖掘和抗冷性机理的研究显得尤为重要,探究小桐子JcMAPK3基因在低温下的表达规律,为深入研究JcMAPK3基因在小桐子抗冷性形成中的功能提供理论基础。【方法】基于小桐子低温锻炼条件下的转录组数据,通过RT-PCR技术克隆小桐子JcMAPK3基因,进行生物信息学分析,采用实时荧光定量qRT-PCR研究JcMAPK3在小桐子不同器官中的表达差异,以及在12 ℃低温锻炼和1 ℃低温胁迫下的表达模式。【结果】克隆到的JcMAPK3基因开放阅读框为1119 bp,编码372个氨基酸,含有STKc_TEY_MAPK激酶催化结构域,蛋白相对分子量为42.82 kD,理论等电点为5.6,分子式为C_(1920)H_(2985)N_(521)O_(551) S_(20)。qRT-PCR分析显示,JcMAPK3基因在根中表达量最高,叶片中表达量最低。在1 ℃低温胁迫下72 h表达量最高,为对照(0 h)的13.5倍;在12 ℃低温锻炼下,JcMAPK3基因表达量在24 h最高,为对照(0 h)的5.58倍。【结论】小桐子JcMAPK3在12 ℃低温锻炼和1 ℃低温胁迫下受到低温诱导表达显著,表明该基因参与小桐子对低温的响应与适应过程。