Hepatitis C virus RNA functionally sequesters miR-122.
Hepatitis C virus RNA functionally sequesters miR-122.
复制标题
DOI：
10.1016/j.cell.2015.02.025
复制
发表时间：
2015-03-12
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Darnell RB
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Luna JM;Scheel TK;Danino T;Shaw KS;Mele A;Fak JJ;Nishiuchi E;Takacs CN;Catanese MT;de Jong YP;Jacobson IM;Rice CM;Darnell RB
丙型肝炎病毒独特地需要肝脏特异的microRNA-122进行复制，但在感染过程中对内源性miRNA靶标的全球影响尚不清楚。在这里，高通量测序和高通量交联免疫沉淀(HITS-CLIP)实验显示，在已知和预测的miR-122位点，人类Argavite(AGO)在丙型肝炎病毒感染期间与丙型肝炎病毒5‘非编码区(UTR)有很强的结合。在人类转录组上，我们观察到病毒感染期间miR-122靶标的AGO结合减少和功能mRNA下调。这种miR-122的“海绵”效应被解除，并通过交换病毒的miRNA趋向性而重定向到miR-15靶点。来自含有miR-122位点的记者的单细胞表达数据显示，在丙型肝炎病毒感染期间，根据表达水平和位点数的不同，显著下调。我们描述了一个丙型肝炎病毒诱导miR-122截留的定量数学模型，并认为这种由丙型肝炎病毒RNA抑制miR-122的作用可能导致宿主miR-122靶点的全局下调，为丙型肝炎病毒的长期致癌潜力提供了一个肥沃的环境。
Hepatitis C virus uniquely requires the liver specific microRNA-122 for replication, yet global effects on endogenous miRNA targets during infection are unexplored. Here, high-throughput sequencing and crosslinking immunoprecipitation (HITS-CLIP) experiments of human Argonaute (Ago) during HCV infection showed robust Ago binding on the HCV 5′UTR, at known and predicted miR-122 sites. On the human transcriptome, we observed reduced Ago binding and functional mRNA de-repression of miR-122 targets during virus infection. This miR-122 “sponge” effect was relieved and redirected to miR-15 targets by swapping the miRNA tropism of the virus. Single-cell expression data from reporters containing miR-122 sites showed significant de-repression during HCV infection depending on expression level and site number. We describe a quantitative mathematical model of HCV induced miR-122 sequestration and propose that such miR-122 inhibition by HCV RNA may result in global de-repression of host miR-122 targets, providing an environment fertile for the long-term oncogenic potential of HCV.
登录
查看更多内容
影响因子：
25.7
作者：
Li, Jiang;Ghazwani, Mohammed;Zhang, Yifei;Lu, Jianqin;Li, Jilong;Fan, Jie;Gandhi, Chandrashekhar R.;Li, Song
通讯作者：
Li, Song
影响因子：
64.5
作者：
Hafner M;Landthaler M;Burger L;Khorshid M;Hausser J;Berninger P;Rothballer A;Ascano M Jr;Jungkamp AC;Munschauer M;Ulrich A;Wardle GS;Dewell S;Zavolan M;Tuschl T
通讯作者：
Tuschl T
影响因子：
56.9
作者：
Jopling, CL;Yi, MK;Sarnow, P
通讯作者：
Sarnow, P
影响因子：
15.9
作者：
Castoldi, Mirco;Spasic, Maja Vujic;Muckenthaler, Martina U.
通讯作者：
Muckenthaler, Martina U.
影响因子：
6.7
作者：
Haecker I;Gay LA;Yang Y;Hu J;Morse AM;McIntyre LM;Renne R
通讯作者：
Renne R