ApoE Modifier Alleles for Alzheimer's Disease Discovered by Information Theory Dependency Measures: MIST Software Package.
ApoE Modifier Alleles for Alzheimer's Disease Discovered by Information Theory Dependency Measures: MIST Software Package.
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通过信息理论依赖度量发现的阿尔茨海默氏病的ApoE修饰等位基因：雾软件包。
DOI：
10.1089/cmb.2022.0185
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发表时间：
2023-03
期刊：
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中科院分区：
文献类型：
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基于信息理论的变量依赖度量（以前发布过）已经实现到一个软件包MIST中。介绍了该软件的设计及其潜在用途，并通过分析UK Biobank数据集，展示了ApoE基因修饰等位基因在影响阿尔茨海默病（AD）中的发现。发现的修饰基因与发现的与AD相关的基因高度重叠。其他包括许多已知会影响AD的药物。我们讨论了使用MIST的依赖性计算的一系列用途，这些计算可以在类似的复杂数据集中发现额外的遗传效应，如更高程度的相互作用和表型多效性。
Information theory-based measures of variable dependency (previously published) have been implemented into a software package, MIST. The design of the software and its potential uses are described, and a demonstration is presented in the discovery of modifier alleles of the ApoE gene in affecting Alzheimer's disease (AD) by analyzing the UK Biobank dataset. The modifier genes uncovered overlap strongly with genes found to be associated with AD. Others include many known to influence AD. We discuss a range of uses of the dependency calculations using MIST that can uncover additional genetic effects in similar complex datasets, like higher degrees of interaction and phenotypic pleiotropy.
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