DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data

DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data
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DOI:
10.1093/bioinformatics/btp187
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发表时间:
2009-06-01
期刊:
影响因子:
5.8
通讯作者:
Rozas, J.
Rozas, J.
中科院分区:
生物学3区
文献类型:
--
作者:
Librado, P.;Rozas, J.

文献摘要

被引文献

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DnaSP是一个用于DNA多态性数据综合分析的软件包。版本5实现了许多新的功能和分析方法,允许在大型数据集上进行广泛的DNA多态性分析。除其他功能外,新实施的方法允许:(i)对多个数据文件进行分析;(ii)单体型定相;(iii)对插入/缺失多态性数据进行分析;(iv)在UCSC浏览器中将滑动窗口结果与可用的基因组注释整合在一起。
Motivation: DnaSP is a software package for a comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Version 5 implements a number of new features and analytical methods allowing extensive DNA polymorphism analyses on large datasets. Among other features, the newly implemented methods allow for: (i) analyses on multiple data files; (ii) haplotype phasing; (iii) analyses on insertion/deletion polymorphism data; (iv) visualizing sliding window results integrated with available genome annotations in the UCSC browser.