Distant positioning of proteasomal proteolysis relative to actively transcribed genes.
Distant positioning of proteasomal proteolysis relative to actively transcribed genes.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkr069
复制
发表时间：
2011-06
影响因子：
14.9
通讯作者：
von Mikecz A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Scharf A;Grozdanov PN;Veith R;Kubitscheck U;Meier UT;von Mikecz A
虽然人们普遍认为泛素-蛋白酶体系统在转录中发挥重要作用，但对其机制基础，特别是转录位点蛋白酶体依赖性蛋白水解的空间组织知之甚少。在这里，我们发现蛋白酶体活性和四泛素化蛋白集中在常染色质的核质微环境中。这种蛋白水解结构域是固定的，并且与转录过程相关地定位明确。对秀丽隐杆线虫胚胎中的基因阵列和早期基因的分析表明，蛋白酶体和蛋白酶体活性相对于转录活性基因来说位置较远。相反，转录抑制通常会诱导蛋白水解微结构域与转录机器组件的局部重叠以及 RNA 聚合酶 II 的降解。结果表明，至少在某些基因中，蛋白酶体活性的空间组织在转录周期的不同阶段方面有所不同，因此可能有助于响应环境刺激的基因表达的可塑性。
While it is widely acknowledged that the ubiquitin–proteasome system plays an important role in transcription, little is known concerning the mechanistic basis, in particular the spatial organization of proteasome-dependent proteolysis at the transcription site. Here, we show that proteasomal activity and tetraubiquitinated proteins concentrate to nucleoplasmic microenvironments in the euchromatin. Such proteolytic domains are immobile and distinctly positioned in relation to transcriptional processes. Analysis of gene arrays and early genes in Caenorhabditis elegans embryos reveals that proteasomes and proteasomal activity are distantly located relative to transcriptionally active genes. In contrast, transcriptional inhibition generally induces local overlap of proteolytic microdomains with components of the transcription machinery and degradation of RNA polymerase II. The results establish that spatial organization of proteasomal activity differs with respect to distinct phases of the transcription cycle in at least some genes, and thus might contribute to the plasticity of gene expression in response to environmental stimuli.
登录
查看更多内容
影响因子：
16
作者：
Anindya, Roy;Ayguen, Ozan;Svejstrup, Jesper Q.
通讯作者：
Svejstrup, Jesper Q.
DOI：
10.1083/jcb.200601105
发表时间：
2006-04-24
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Darzacq X;Kittur N;Roy S;Shav-Tal Y;Singer RH;Meier UT
通讯作者：
Meier UT
DOI：
10.1083/jcb.129.2.287
发表时间：
1995-04
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Bregman DB;Du L;van der Zee S;Warren SL
通讯作者：
Warren SL
影响因子：
3
作者：
Kiesslich, A;von Mikecz, A;Hemmerich, P
通讯作者：
Hemmerich, P
影响因子：
16
作者：
Ferdous, A;Gonzalez, F;Johnston, SA
通讯作者：
Johnston, SA