A distance-weighted interaction map reveals a previously uncharacterized layer of the Bacillus subtilis spore coat.
A distance-weighted interaction map reveals a previously uncharacterized layer of the Bacillus subtilis spore coat.
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DOI：
10.1016/j.cub.2010.03.060
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发表时间：
2010-05-25
期刊：
影响因子：
9.2
通讯作者：
Eichenberger, Patrick
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
McKenney, Peter T.;Driks, Adam;Eskandarian, Haig A.;Grabowski, Paul;Guberman, Jonathan;Wang, Katherine H.;Gitai, Zemer;Eichenberger, Patrick
枯草芽孢杆菌孢子被包裹在一种称为孢子衣的蛋白质组装体中，该蛋白质组装体由至少70种不同的蛋白质组成。传统的电子显微镜显示涂层被组织成两个不同的层。由于外壳大约与光学显微镜的理论极限一样宽，因此定量测量外壳内单个外壳蛋白的定位具有挑战性。我们使用外壳蛋白与GFP的融合来绘制外壳组装的遗传依赖性，并定义了外壳蛋白的三个独立子网络。为了补充遗传数据，我们以亚像素分辨率测量外壳蛋白定位，并整合这两个数据集以产生距离加权遗传相互作用图。使用这些数据，我们预测，涂层包括至少四个空间上不同的层，包括以前未知的糖蛋白最外层，我们命名为孢子壳。我们发现，地壳组装取决于我们预测定位到地壳的蛋白质。芽孢杆菌芽孢的外壳可能在所有芽孢中都存在，并在环境中发挥重要作用。
Bacillus subtilis spores are encased in a protein assembly called the spore coat that is made up of at least 70 different proteins. Conventional electron microscopy shows the coat to be organized into two distinct layers. Because the coat is about as wide as the theoretical limit of light microscopy, quantitatively measuring the localization of individual coat proteins within the coat is challenging. We used fusions of coat proteins to GFP to map genetic dependencies for coat assembly and define three independent sub-networks of coat proteins. To complement the genetic data, we measured coat protein localization at sub-pixel resolution and integrated these two data sets to produce a distance-weighted genetic interaction map. Using these data we predict that the coat comprises at least four spatially distinct layers, including a previously uncharacterized glycoprotein outermost layer that we name the spore crust. We found that crust assembly depends on proteins we predicted to localize to the crust. The crust may be conserved in all Bacillus spores and may play critical functions in the environment.
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影响因子：
3.2
作者：
Krajcikova, Daniela;Lukacova, Magda;Barak, Imrich
通讯作者：
Barak, Imrich
DOI：
10.1016/j.cub.2009.02.056
发表时间：
2009-04-28
期刊：
Current biology : CB
影响因子：
--
作者：
Joglekar AP;Bloom K;Salmon ED
通讯作者：
Salmon ED
影响因子：
3.2
作者：
Ozin, AJ;Samford, CS;Moran, CP
通讯作者：
Moran, CP
影响因子：
2.8
作者：
Redmond, C;Baillie, LWJ;Moir, A
通讯作者：
Moir, A
影响因子：
3.2
作者：
Imamura, Daisuke;Kuwana, Ritsuko;Watabe, Kazuhito
通讯作者：
Watabe, Kazuhito