Clinical Sequencing Defines the Genomic Landscape of Metastatic Colorectal Cancer.
Clinical Sequencing Defines the Genomic Landscape of Metastatic Colorectal Cancer.
复制标题
DOI：
10.1016/j.ccell.2017.12.004
复制
发表时间：
2018-01-08
期刊：
影响因子：
50.3
通讯作者：
Schultz N
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yaeger R;Chatila WK;Lipsyc MD;Hechtman JF;Cercek A;Sanchez-Vega F;Jayakumaran G;Middha S;Zehir A;Donoghue MTA;You D;Viale A;Kemeny N;Segal NH;Stadler ZK;Varghese AM;Kundra R;Gao J;Syed A;Hyman DM;Vakiani E;Rosen N;Taylor BS;Ladanyi M;Berger MF;Solit DB;Shia J;Saltz L;Schultz N
转移性结直肠癌（mCRC）在临床上是异质性的，但这种变异性的基因组基础仍然知之甚少。我们对1134个CRC进行了前瞻性靶向测序。我们确定了APC内含子区域的剪接改变和CTNNB1的大框内缺失，将致癌WNT通路改变增加到96%的CRC。与左侧原发灶相比，微卫星稳定型mCRC的右侧原发灶与生存期短、诊断年龄大、突变增加以及KRAS、BRAF、PIK3CA、AKT1、RNF43和SMAD4致癌改变富集相关。左侧肿瘤通常在促有丝分裂信号传导中没有可识别的遗传改变，但表现出更高的促有丝分裂配体表达。我们的研究结果表明，在右侧和左侧微卫星稳定的CRC中，不同的肿瘤发生途径可能是临床差异的基础。
Metastatic colorectal cancers (mCRCs) are clinically heterogeneous, but the genomic basis of this variability remains poorly understood. We performed prospective targeted sequencing of 1134 CRCs. We identified splice alterations in intronic regions of APC and large in-frame deletions in CTNNB1, increasing oncogenic WNT pathway alterations to 96% of CRCs. Right-sided primary site in microsatellite stable mCRC was associated with shorter survival, older age at diagnosis, increased mutations, and enrichment of oncogenic alterations in KRAS, BRAF, PIK3CA, AKT1, RNF43, and SMAD4 compared to left-sided primaries. Left-sided tumors frequently had no identifiable genetic alteration in mitogenic signaling, but exhibited higher mitogenic ligand expression. Our results suggest different pathways to tumorigenesis in right- and left-sided microsatellite stable CRC that may underlie clinical differences.
登录
查看更多内容
影响因子：
8.8
作者：
Lee MS;McGuffey EJ;Morris JS;Manyam G;Baladandayuthapani V;Wei W;Morris VK;Overman MJ;Maru DM;Jiang ZQ;Hamilton SR;Kopetz S
通讯作者：
Kopetz S
影响因子：
24.5
作者：
Flemer B;Lynch DB;Brown JM;Jeffery IB;Ryan FJ;Claesson MJ;O'Riordain M;Shanahan F;O'Toole PW
通讯作者：
O'Toole PW
影响因子：
3.5
作者：
Church DN;Briggs SE;Palles C;Domingo E;Kearsey SJ;Grimes JM;Gorman M;Martin L;Howarth KM;Hodgson SV;NSECG Collaborators;Kaur K;Taylor J;Tomlinson IP
通讯作者：
Tomlinson IP
DOI：
10.1038/modpathol.2016.198
发表时间：
2017-04
期刊：
Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
影响因子：
--
作者：
Shia J;Schultz N;Kuk D;Vakiani E;Middha S;Segal NH;Hechtman JF;Berger MF;Stadler ZK;Weiser MR;Wolchok JD;Boland CR;Gönen M;Klimstra DS
通讯作者：
Klimstra DS
影响因子：
7
作者：
Dees ND;Zhang Q;Kandoth C;Wendl MC;Schierding W;Koboldt DC;Mooney TB;Callaway MB;Dooling D;Mardis ER;Wilson RK;Ding L
通讯作者：
Ding L