A primer on deep learning in genomics
A primer on deep learning in genomics
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DOI：
10.1038/s41588-018-0295-5
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发表时间：
2019-01-01
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Telenti, Amalio
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zou, James;Huss, Mikael;Telenti, Amalio
深度学习方法是一类能够识别大型数据集中高度复杂模式的机器学习技术。在这里，我们提供了关于深度学习在基因组分析中的应用的观点和入门。我们讨论了在调控基因组学，变异呼叫和致病性分数领域的成功应用。我们包括如何有效使用深度学习方法的一般指导以及工具和资源的实用指南。这本入门书附有一个互动的在线教程。
Deep learning methods are a class of machine learning techniques capable of identifying highly complex patterns in large datasets. Here, we provide a perspective and primer on deep learning applications for genome analysis. We discuss successful applications in the fields of regulatory genomics, variant calling and pathogenicity scores. We include general guidance for how to effectively use deep learning methods as well as a practical guide to tools and resources. This primer is accompanied by an interactive online tutorial.