茶树肌动蛋白基因（CsActin1）全长cDNA克隆与生物信息学分析
茶树肌动蛋白基因（CsActin1）全长cDNA克隆与生物信息学分析
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DOI：
10.7525/j.issn.1673-5102.2012.01.012
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发表时间：
2012-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
马春雷
中科院分区：
文献类型：
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作者：
王新超;杨亚军;马春雷
以茶树（Camellia sinensis）萌动芽为材料,根据茶树萌动芽芽抑制消减杂交文库中分离得到的肌动蛋白（actin）基因的5＇-片段设计引物,利用3＇-RACE技术克隆了其cDNA全长序列,该基因cDNA全长1 470 bp,命名为CsActin1（GenBank登录号HQ235647）。序列分析表明,CsActin1开放阅读框长1 134 bp,编码377个氨基酸,5＇非编码区100 bp,3＇非编码区236 bp。推测的蛋白质分子量为41.70 kD,等电点约为5.31,具有肌动蛋白家族的特征信号序列（YVGDEAQs.KRG和WIAKaEYDE）和肌动蛋白相关蛋白的特征信号序列（LLTEApLNPkaNR）。CsActin1与GenBank中注册的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在80%以上,氨基酸序列相似性在95%以上。与其它植物肌动蛋白的进化树分析结果表明,茶树肌动蛋白与杨树的两个肌动蛋白间的亲缘关系最为密切。并对推导的蛋白结构进行了分析。