MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches

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DOI：
10.1093/bioinformatics/bty1057
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发表时间：
2019-08-15
期刊：
BIOINFORMATICS
影响因子：
5.8
通讯作者：
Soeding, Johannes
Soeding, Johannes
中科院分区：
生物学3区
文献类型：
--
作者：
Mirdita, Milot;Steinegger, Martin;Soeding, Johannes

文献摘要

被引文献

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一个总结：MMseqs2桌面和Web服务器应用程序通过个人工作站上的自定义蛋白质序列和配置文件数据库促进交互式序列搜索。通过消除MMseqs2的运行时开销，我们在接近BLAST的敏感度下将响应时间缩短到了几秒钟。
A Summary: The MMseqs2 desktop and web server app facilitates interactive sequence searches through custom protein sequence and profile databases on personal workstations. By eliminating MMseqs2's runtime overhead, we reduced response times to a few seconds at sensitivities close to BLAST.