Between a Pod and a Hard Test: The Deep Evolution of Amoebae.
Between a Pod and a Hard Test: The Deep Evolution of Amoebae.
复制标题
DOI：
10.1093/molbev/msx162
复制
发表时间：
2017-09-01
影响因子：
10.7
通讯作者：
Brown MW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kang S;Tice AK;Spiegel FW;Silberman JD;Pánek T;Cepicka I;Kostka M;Kosakyan A;Alcântara DMC;Roger AJ;Shadwick LL;Smirnov A;Kudryavtsev A;Lahr DJG;Brown MW
变形虫是变形虫的真核超级类群姐妹，变形虫的谱系包括动物和真菌，以及它们的原生动物亲戚，以及短鞭毛虫和单胞鞭毛虫。变形虫种类繁多，包括重要的模式生物和重要的病原体。尽管变形虫是全球营养循环的组成部分，并且几乎存在于所有环境中，但对它们的研究还远远不够。我们提出了一个强大的阿米巴原虫系统发育基于广泛的代表性的分类群在系统基因组框架（325个基因）。通过使用基于培养和单细胞转录组学的方法对61个类群进行采样，我们的分析显示了变形虫的两个主要分支，Discosea和Tevosa。这一系统发育在主要方面驳斥了以前的研究。我们的研究结果支持了阿米巴虫最后的共同祖先是有性和鞭毛的假设，它也可能具有从孢子型子实体中分散繁殖体的能力。总的来说，阿米巴虫的主要宏观进化模式似乎是由于在包括鞭毛、性别和孢子囊在内的多相生命周期中同源性状的平行丧失，而不是独立获得趋同特征。
Amoebozoa is the eukaryotic supergroup sister to Obazoa, the lineage that contains the animals and Fungi, as well as their protistan relatives, and the breviate and apusomonad flagellates. Amoebozoa is extraordinarily diverse, encompassing important model organisms and significant pathogens. Although amoebozoans are integral to global nutrient cycles and present in nearly all environments, they remain vastly understudied. We present a robust phylogeny of Amoebozoa based on broad representative set of taxa in a phylogenomic framework (325 genes). By sampling 61 taxa using culture-based and single-cell transcriptomics, our analyses show two major clades of Amoebozoa, Discosea, and Tevosa. This phylogeny refutes previous studies in major respects. Our results support the hypothesis that the last common ancestor of Amoebozoa was sexual and flagellated, it also may have had the ability to disperse propagules from a sporocarp-type fruiting body. Overall, the main macroevolutionary patterns in Amoebozoa appear to result from the parallel losses of homologous characters of a multiphase life cycle that included flagella, sex, and sporocarps rather than independent acquisition of convergent features.
登录
查看更多内容
影响因子：
3.7
作者：
Lahr DJ;Grant J;Nguyen T;Lin JH;Katz LA
通讯作者：
Katz LA
影响因子：
10.7
作者：
Fahrni, JF;Bolivar, I;Pawlowski, J
通讯作者：
Pawlowski, J
DOI：
10.1098/rspb.2013.1755
发表时间：
2013-10-22
影响因子：
4.7
作者：
Brown, Matthew W.;Sharpe, Susan C.;Roger, Andrew J.
通讯作者：
Roger, Andrew J.
影响因子：
2.5
作者：
Brown, Matthew W.;Silberman, Jeffrey D.;Spiegel, Frederick W.
通讯作者：
Spiegel, Frederick W.
影响因子：
10.7
作者：
Nguyen LT;Schmidt HA;von Haeseler A;Minh BQ
通讯作者：
Minh BQ