Adaptive smoothed molecular dynamics for multiscale modeling
Adaptive smoothed molecular dynamics for multiscale modeling
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用于多尺度建模的自适应平滑分子动力学
DOI：
10.1016/j.commatsci.2009.02.023
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发表时间：
2009-09
影响因子：
3.3
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
在平滑分子动力学（SMD）中，原子运动中的高频模被消除，从而大大增大了时间步长。然而，在某些情况下，可能发生重排或原子无序。因此，希望在局部区域中使用MD来捕获感兴趣的高频运动，而在其他地方使用SMD来节省计算成本。本文提出了一种自适应平滑分子动力学（ASMD）。在模拟过程中，如果原子的高频运动在一个区域中占主导地位，则该区域中的背景网格被分层细化，直到它能够捕获原子的高频运动。
In the smoothed molecular dynamics (SMD), the high frequency modes are eliminated from the motion of atoms to enlarge the time step significantly. In some situations, however, rearrangements or atoms disorder may occur. Hence, it is desirable to use MD in localized regions to capture the interesting high frequency motion, while use SMD elsewhere to save the computational cost. In this paper, an adaptive smoothed molecular dynamics (ASMD) is developed. During the simulation process, if the high frequency motions of atoms are dominant in a region, the background grid in the region is refined hierarchically until it is able to capture the high frequency motion of the atoms.
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DOI：
10.1016/s0022-5096(98)00051-9
发表时间：
1999-03-01
影响因子：
5.3
作者：
Shenoy, VB;Miller, R;Ortiz, M
通讯作者：
Ortiz, M
DOI：
10.1016/0045-7825(94)90112-0
发表时间：
1993-06
影响因子：
7.2
作者：
D. Sulsky;Zhen Chen;H. Schreyer
通讯作者：
D. Sulsky;Zhen Chen;H. Schreyer
影响因子：
2.4
作者：
Yan Liu;Xiong Zhang;K. Sze;Min Wang
通讯作者：
Yan Liu;Xiong Zhang;K. Sze;Min Wang
DOI：
10.1016/0045-7825(94)00033-6
发表时间：
1994-09-01
影响因子：
7.2
作者：
SULSKY, D;CHEN, Z;SCHREYER, HL
通讯作者：
SCHREYER, HL