Genome-wide analysis of GATA transcription factor in hematopoietic cells
Genome-wide analysis of GATA transcription factor in hematopoietic cells
复制标题
造血细胞 GATA 转录因子的全基因组分析
DOI：
10.11406/rinketsu.53.287
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Fujiwara T
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Suzuki;M.;Fujiwara T
細胞分化における遺伝子発現の調節には細胞系列特異的な転写因子が関与していると考えられており, このうち血球細胞の分化においては, GATA 転写因子群が重要な役割を果たしている 1∼ 5). GATA 転写因子は GATA-1 から GATA-6 まで報告されており, このうち血球細胞の分化に重要なのは GATA-1, GATA-2, GATA-3 で ある 1, 5, 6). GATA-2 は造血幹細胞において発現し, その維持・増殖に重要な役割を果たしている 7). また一部において重複した発現はみられるものの, GATA-1 は GATA-2 に次いで発現し, 赤芽球, 巨核球, 好酸球, 肥満細胞の分化に関与する 8∼ 11). 一方, GATA-3 は T 細胞の分化に重要である 12).GATA 転写因子群は共通して 2 つのジンクフィンガーモチーフを有する事が報告されている 13). これらのモチーフは, 様々な共役因子との相互作用, GATA 蛋白質の安定性に関与するとともに, ゲノム DNA 上の (A/T) GATA (A/G)(= WGATAR) 配列を認識し, 多くの遺伝子の発現を制御する事が報告されている 5, 13∼ 16). 全ゲノム上には, 非常に数多くの “WGATAR” 配列が存在する事が予想されるが, 実際に GATA 転写因子が結合し得る頻度は, たとえ種を超えて保存されている WGATAR 配列であっても非常に低い事が, これまでの一部のゲノム領域における検討により明らかとされている 17, 18). この知見から, 単純な WGATAR 配列以外に GATA 転写因子とクロマチン DNA の結合を規定・予測しうる因子が他に存在しうるか, この 「GATA factor chromatin occupancy rule」 の一端を解明する目的で,