A comparative lipidomics platform for chemotaxonomic analysis of Mycobacterium tuberculosis.
A comparative lipidomics platform for chemotaxonomic analysis of Mycobacterium tuberculosis.
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用于结核分枝杆菌化学分类学分析的比较脂质组学平台。
DOI：
10.1016/j.chembiol.2011.10.013
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发表时间：
2011-12-23
影响因子：
--
通讯作者：
Moody DB
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Layre E;Sweet L;Hong S;Madigan CA;Desjardins D;Young DC;Cheng TY;Annand JW;Kim K;Shamputa IC;McConnell MJ;Debono CA;Behar SM;Minnaard AJ;Murray M;Barry CE 3rd;Matsunaga I;Moody DB
结核分枝杆菌的外膜以多种方式促进毒力，因此我们开发了一个脂质组学平台，用于广泛调查细胞壁。在这里，我们报告了两个新的数据库（MycoMass，MycoMap），30个脂质精细图和质谱数据集，包括一个静态的lipidome。此外，通过在生物过程中快速再生脂质组学数据集，比较脂质组学提供了统计上有效的、全生物体范围的比较，可以广泛评估感染期间或分支杆菌临床菌株之间的脂质变化。使用严格的数据过滤器，我们平行跟踪了5,000多个分子特征，几乎没有或没有假阳性分子发现。低错误率允许分枝杆菌的第一个化学分类学分析，描述了每种菌株的化学变化程度，并确定了特定的菌株特异性分子用作生物标志物。
The lipidic envelope of Mycobacterium tuberculosis promotes virulence in many ways, so we developed a lipidomics platform for broad survey of cell walls. Here we report two new databases (MycoMass, MycoMap), 30 lipid fine maps and mass spectrometry datasets that comprise a static lipidome. Further, by rapidly regenerating lipidomic datasets during biological processes, comparative lipidomics provides statistically valid, organism-wide comparisons that broadly assess lipid changes during infection or among clinical strains of mycobacteria. Using stringent data filters, we tracked more than 5,000 molecular features in parallel with few or no false positive molecular discoveries. The low error rates allowed the first chemotaxonomic analyses of mycobacteria, which describe the extent of chemical change in each strain and identified particular strain-specific molecules for use as biomarkers.
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DOI：
10.1073/pnas.0610634104
发表时间：
2007-03-20
影响因子：
11.1
作者：
Jain, Madhulika;Petzold, Christopher J.;Cox, Jeffery S.
通讯作者：
Cox, Jeffery S.
影响因子：
--
作者：
de Carvalho, Luiz Pedro S.;Fischer, Steven M.;Rhee, Kyu Y.
通讯作者：
Rhee, Kyu Y.
DOI：
10.7883/yoken1952.23.315
发表时间：
1970-01-01
期刊：
JAPANESE JOURNAL OF MEDICAL SCIENCE & BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
KONDO, E;KANAI, K;TSUMITA, T
通讯作者：
TSUMITA, T
由巨噬细胞诱导的外排机制介导的复制分枝杆菌的药物耐受性。
影响因子：
64.5
作者：
Adams KN;Takaki K;Connolly LE;Wiedenhoft H;Winglee K;Humbert O;Edelstein PH;Cosma CL;Ramakrishnan L
通讯作者：
Ramakrishnan L
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
影响因子：
5.8
作者：
BENJAMINI, Y;HOCHBERG, Y
通讯作者：
HOCHBERG, Y