CEP: a conformational epitope prediction server.
CEP: a conformational epitope prediction server.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gki460
复制
发表时间：
2005-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kolaskar, AS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kulkarni-Kale, U;Bhosle, S;Kolaskar, AS
CEP 服务器 () 为内部开发的构象表位预测算法提供了一个 Web 界面。该算法除了预测构象表位外，还预测抗原决定簇和顺序表位。使用蛋白质抗原的 3D 结构数据来预测表位，这些数据可以以图形方式可视化。该算法采用基于结构的生物信息学方法和以显式方式对氨基酸进行溶剂可及性。使用 PDB 中提供的 Ag-Ab 复合物的 X 射线晶体结构进行评估时，发现该算法的准确度为 75%。这是第一个也是唯一一个可用于预测构象表位的方法，这是一种绘制蛋白质抗原可能的抗体结合位点图谱的尝试。
CEP server () provides a web interface to the conformational epitope prediction algorithm developed in-house. The algorithm, apart from predicting conformational epitopes, also predicts antigenic determinants and sequential epitopes. The epitopes are predicted using 3D structure data of protein antigens, which can be visualized graphically. The algorithm employs structure-based Bioinformatics approach and solvent accessibility of amino acids in an explicit manner. Accuracy of the algorithm was found to be 75% when evaluated using X-ray crystal structures of Ag–Ab complexes available in the PDB. This is the first and the only method available for the prediction of conformational epitopes, which is an attempt to map probable antibody-binding sites of protein antigens.
登录
查看更多内容
影响因子：
5.5
作者：
Alix, AJP
通讯作者：
Alix, AJP
影响因子：
3.7
作者：
Kolaskar, AS;Kulkarni-Kale, U
通讯作者：
Kulkarni-Kale, U
影响因子：
5.7
作者：
MALBY, RL;TULIP, WR;COLMAN, PM
通讯作者：
COLMAN, PM
影响因子：
5.8
作者：
McConkey, BJ;Sobolev, V;Edelman, M
通讯作者：
Edelman, M
影响因子：
5.6
作者：
SHERIFF, S;HENDRICKSON, WA;SMITH, JL
通讯作者：
SMITH, JL