Residue-specific structural kinetics of proteins through the union of isotope labeling, mid-IR pulse shaping, and coherent 2D IR spectroscopy.
Residue-specific structural kinetics of proteins through the union of isotope labeling, mid-IR pulse shaping, and coherent 2D IR spectroscopy.
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DOI：
10.1016/j.ymeth.2010.05.002
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发表时间：
2010-09
期刊：
影响因子：
4.8
通讯作者：
Zanni, Martin T.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Middleton, Chris T.;Woys, Ann Marie;Mukherjee, Sudipta S.;Zanni, Martin T.
关键词：
我们描述了一种使用快速扫描技术收集二维红外光谱来研究蛋白质动力学的方法。与同位素标记相结合，二维红外光谱能够探测多肽和蛋白质中单个残基的二级结构和环境。它对于膜蛋白和聚集蛋白特别有用。我们的快速扫描技术依赖于中红外脉冲整形器，计算机可以生成脉冲形状，就像核磁共振波谱仪一样。有了这个设备，数据收集变得更快、更容易、更准确。我们描述了我们的 2D IR 光谱仪以及 13C=18O 同位素标记方案，然后举例说明了该技术在 2 型糖尿病中人胰岛淀粉样蛋白多肽聚集中的应用。
We describe a methodology for studying protein kinetics using a rapid-scan technology for collecting 2D IR spectra. In conjunction with isotope labeling, 2D IR spectroscopy is able to probe the secondary structure and environment of individual residues in polypeptides and proteins. It is particularly useful for membrane and aggregate proteins. Our rapid-scan technology relies on a mid-IR pulse shaper that computer generates the pulse shapes, much like in an NMR spectrometer. With this device, data collection is faster, easier, and more accurate. We describe our 2D IR spectrometer, as well as protocols for 13C=18O isotope labeling, and then illustrate the technique with an application to the aggregation of the human islet amyloid polypeptide form type 2 diabetes.
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影响因子：
15
作者：
DeFlores, Lauren P.;Ganim, Ziad;Tokmakoff, Andrei
通讯作者：
Tokmakoff, Andrei
DOI：
10.1364/josab.27.000382
发表时间：
2010-03-01
影响因子：
1.9
作者：
Anna, Jessica M.;Nee, Matthew J.;Kubarych, Kevin J.
通讯作者：
Kubarych, Kevin J.
影响因子：
3.8
作者：
Fetterman, MR;Goswami, D;Warren, WS
通讯作者：
Warren, WS
影响因子：
--
作者：
ANFINRUD, PA;HAN, CH;HOCHSTRASSER, RM
通讯作者：
HOCHSTRASSER, RM
DOI：
10.1073/pnas.0700959104
发表时间：
2007-09-04
影响因子：
11.1
作者：
Chung, Hoi Sung;Ganim, Ziad;Tokmakoff, Andrei
通讯作者：
Tokmakoff, Andrei