APCluster: an R package for affinity propagation clustering
APCluster: an R package for affinity propagation clustering
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btr406
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发表时间：
2011-09-01
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Hochreiter, Sepp
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bodenhofer, Ulrich;Kothmeier, Andreas;Hochreiter, Sepp
近些年来，亲和传播(AP)聚类在生物信息学中得到了越来越广泛的应用。AP集群的优势在于，它允许确定典型的集群成员，即所谓的样本。为了解释R在生物信息学中的普遍存在，我们提供了这一有前景的新集群技术的R实现。本文介绍了该程序包，并从结构生物学的角度给出了它的一个应用。
Affinity propagation (AP) clustering has recently gained increasing popularity in bioinformatics. AP clustering has the advantage that it allows for determining typical cluster members, the so-called exemplars. We provide an R implementation of this promising new clustering technique to account for the ubiquity of R in bioinformatics. This article introduces the package and presents an application from structural biology.