Comparison of ligand-binding sites of modeled apo[a] kringle-like sequences in human lipoprotein[a].
Comparison of ligand-binding sites of modeled apo[a] kringle-like sequences in human lipoprotein[a].
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人脂蛋白[a]中模拟apo[a]三环样序列的配体结合位点的比较。
DOI：
10.1161/01.atv.13.5.758
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发表时间：
1993
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Morrisett,JD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
GuevaraJr,J;Jan,AY;Knapp,R;Tulinsky,A;Morrisett,JD
人脂蛋白[a]包含至少两种高分子量、二硫键连接的载脂蛋白：apo[a]和apo B-100。 Apo[a] 是一种高度糖基化的亲水性脱辅基蛋白，它含有延伸的三环结构域和羧基末端丝氨酸蛋白酶结构域，因此在某种程度上类似于纤溶酶原。 apo[a] kringle 结构域由 11 种不同的 kringle 类型组成。其中 10 个与纤溶酶原 kringle 4 (PGK4) 显示出高度的序列同源性。 PGK4的晶体坐标用于生成apo[a]三环类型的三维分子模型，并且PGK4的赖氨酸结合区域用于比较apo[a]的每个不同的PGK4样三环中包含的不同潜在受体-配体和配体结合位点。可以为每种三环类型提出受体-配体位点。潜在的丝氨酸蛋白酶裂解位点（包含精氨酸-苏氨酸和苏氨酸-精氨酸）位于三环表面。一种apo[a]三环模型的配体结合位点与PGK4几乎相同，并且可能是apo[a]的赖氨酸结合位点。其他四种apo[a]三环模型似乎具有结构相似的赖氨酸结合位点，但存在可能影响配体-多肽特异性的差异。五个 apo[a] kringle 模型具有可能不结合赖氨酸的配体结合位点；其中之一是已知的 apo[a] 多晶型物中高度重复的三环。
Human lipoprotein[a] contains at least two high-molecular-weight, disulfide-linked apolipoproteins, apo[a] and apo B-100. Apo[a] is a highly glycosylated, hydrophilic apoprotein that somewhat resembles plasminogen by containing an extended kringle domain and a carboxyl-terminal serine protease domain. The apo[a] kringle domain is composed of 11 distinct kringle types. Ten of these display high sequence homology to plasminogen kringle 4 (PGK4). The crystallographic coordinates for PGK4 were used to generate three-dimensional molecular models of the apo[a] kringle types, and the lysine-binding region of PGK4 was used to compare the different potential receptor-ligand and ligand-binding sites contained in each different PGK4-like kringle of apo[a]. A receptor-ligand site can be proposed for each kringle type. Potential serine protease cleavage sites, containing arginine-threonine and threonine-arginine, are located on the surface of the kringles. The ligand-binding site of one apo[a] kringle model is almost identical to that of PGK4 and may be a lysine-binding site of apo[a]. Four other apo[a] kringle models appear to have structurally similar lysine-binding sites, but with differences that may influence ligand-polypeptide specificity. Five apo[a] kringle models have ligand-binding sites that probably do not bind lysine; one of these is the highly repeated kringle in the known apo[a] polymorph.
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影响因子：
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通讯作者：
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--
发表时间：
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影响因子：
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J. Guevara
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