团头鲂 Hox 基因家族的鉴定、进化与表达分析

团头鲂 Hox 基因家族的鉴定、进化与表达分析
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DOI:
10.11964/20200612288
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发表时间:
2021-02
期刊:
水产学报
影响因子:
--
通讯作者:
王卫民
王卫民
中科院分区:
其他
文献类型:
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作者:
刘宁;黄欣;刘寒;王卫民

文献摘要

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为探究团头鲂Hox的分布、进化及表达调控,实验基于团头鲂全基因组数据,结合生物信息学分析方法对Hox基因家族进行鉴定、染色体分布、系统进化和表达分析。结果显示,团头鲂基因组中鉴定有49个Hox,根据系统进化树聚集为5个亚类;49个Hox分属于7个基因连锁群(HoxAa、HoxAb、HoxBa、HoxBb、HoxCa、HoxCb和HoxDa),并且不均匀地分布在5条染色体上;团头鲂Hox基因家族成员具有不同的表达模式,在肌肉中的表达水平与斑马鱼所有Hox的表达存在显著差异;团头鲂不同发育阶段及不同组织的转录