Automatic annotation of organellar genomes with DOGMA
Automatic annotation of organellar genomes with DOGMA
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DOI：
10.1093/bioinformatics/bth352
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发表时间：
2004-11-22
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Boore, JL
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Wyman, SK;Jansen, RK;Boore, JL
双细胞器基因组注释（Dogma）自动化细胞器（植物叶绿体和动物线粒体）基因组的注释。它是一个基于Web的软件包，允许使用自定义数据库的BLAST搜索，并在动物线粒体TRNA的二级结构中保存基底式搜索以识别和注释基因。 Dogma提供了用于查看和编辑注释的图形用户界面。注释存储在我们的受密码保护的服务器上，以启用在同一基因组上工作的重复课程。可以提取完成的注释以直接提交给GenBank。
The Dual Organellar GenoMe Annotator (DOGMA) automates the annotation of organellar (plant chloroplast and animal mitochondrial) genomes. It is a Web-based package that allows the use of BLAST searches against a custom database, and conservation of basepairing in the secondary structure of animal mitochondrial tRNAs to identify and annotate genes. DOGMA provides a graphical user interface for viewing and editing annotations. Annotations are stored on our password-protected server to enable repeated sessions of working on the same genome. Finished annotations can be extracted for direct submission to GenBank.