水稻抗潜根线虫基因OsRAI1的克隆及功能分析

水稻抗潜根线虫基因OsRAI1的克隆及功能分析
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DOI:
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2021-0362
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发表时间:
2021
期刊:
生物技术通报
影响因子:
--
通讯作者:
崔汝强
崔汝强
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
山草梅;叶蕾;张连虎;况卫刚;孙晓棠;马建;崔汝强

文献摘要

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水稻潜根线虫病是江西省水稻生产上危害严重的病害之一。前期通过对水稻细尖潜根线虫侵染抗/感病水稻品种的根部组织进行比较转录组分析,筛选出差异表达上调基因OsRAI1。本研究克隆获得OsRAI1全长,通过蛋白结构预测、亚细胞定位对其功能进行分析,通过IPTG诱导,对OsRAI1蛋白表达条件进行了优化。结果表明,OsRAI1基因ORF全长1 065 bp,编码354个氨基酸,属于bHLH转录因子家族。该蛋白为亲水性蛋白,分子量37.90 kD,pI值4.86,脂肪系数68.33,总平均亲水性(GRAVY)-0.415,为非跨膜蛋白。蛋白互作预测显示该蛋白可能是通过两个蛋白间HLH区域相互结合作用。亚细胞定位结果表明该蛋白在细胞核中表达。可溶性蛋白在0.6 mmol/L IPTG 16℃诱导18 h后表达量最高。本研究结果为进一步阐明水稻抗潜根线虫分子机制奠定基础。