A study of Caenorhabditis elegans DAF-2 mutants by metabolomics and differential correlation networks.
A study of Caenorhabditis elegans DAF-2 mutants by metabolomics and differential correlation networks.
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DOI：
10.1039/c3mb25539e
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发表时间：
2013-07
影响因子：
--
通讯作者：
Griffin JL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Castro C;Krumsiek J;Lehrbach NJ;Murfitt SA;Miska EA;Griffin JL
daf-2是秀丽隐杆线虫中研究最多的突变体之一：它在胰岛素/胰岛素样生长因子（IGF）受体的基因直向同源物中含有缺失。使用高分辨率1H NMR光谱，代谢组学有助于剖析改变的daf-2信号的代谢后果。在这里，我们提出了一个详细的代谢组学分析的daf-2，使用NMR光谱，气相色谱-质谱（GC-MS）和液相色谱-质谱（LC-MS），以整合不同途径的信息。然后，我们使用Pearson和偏相关分析来构建网络，以探索daf-2在调节脂肪酸和氨基酸代谢中的核心作用。结果显示了代谢组的这两个部分之间的紧密联系。
daf-2 is one of the most studied mutants in C.elegans: it contains a deletion in the gene orthologue of the insulin/insulin-like growth factor (IGF) receptor. Using high resolution 1H NMR spectroscopy, metabolomics has helped to dissect the metabolic consequences of altered daf-2 signalling. Here, we present a detailed metabolomic analysis of daf-2, using NMR spectroscopy, gas chromatographymass spectrometry (GC-MS) and liquid chromatography mass spectrometry (LC-MS) to integrate information from different pathways. We have then used Pearson and partial correlation analysis to build networks to explore the central role of daf-2 in regulating fatty acid and amino acid metabolism. The results show the tight link between these two parts of the metabolome.
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影响因子：
--
作者：
Krumsiek J;Suhre K;Illig T;Adamski J;Theis FJ
通讯作者：
Theis FJ
影响因子：
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作者：
Valcárcel B;Würtz P;Seich al Basatena NK;Tukiainen T;Kangas AJ;Soininen P;Järvelin MR;Ala-Korpela M;Ebbels TM;de Iorio M
通讯作者：
de Iorio M
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作者：
Castro C;Sar F;Shaw WR;Mishima M;Miska EA;Griffin JL
通讯作者：
Griffin JL
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作者：
Zarse K;Schmeisser S;Groth M;Priebe S;Beuster G;Kuhlow D;Guthke R;Platzer M;Kahn CR;Ristow M
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Ristow M
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作者：
Fuchs S;Bundy JG;Davies SK;Viney JM;Swire JS;Leroi AM
通讯作者：
Leroi AM