Inhibitory mechanism of reveromycin A at the tRNA binding site of a class I synthetase.
Inhibitory mechanism of reveromycin A at the tRNA binding site of a class I synthetase.
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白藜芦醇 A 对 I 类合成酶 tRNA 结合位点的抑制机制
DOI：
10.1038/s41467-021-21902-0
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发表时间：
2021-03-12
影响因子：
16.6
通讯作者：
Zhou H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chen B;Luo S;Zhang S;Ju Y;Gu Q;Xu J;Yang XL;Zhou H
聚酮化合物天然产物回复霉素A（reveromycin A，RM-A）通过选择性抑制真核细胞质异亮氨酰-tRNA合成酶（IleRS）而表现出抗真菌、抗癌、抗骨转移、抗牙周炎和抗骨质疏松的活性。本文中，共晶体结构表明RM-A分子通过部分模拟tRNAIle的结合而占据Saccharomyces gleIleRS（ScIleRS）的底物tRNAIle结合位点。RM-A结合由共纯化的中间产物异亮氨酰-腺苷酸（Ile-AMP）促进。结合试验证实，RM-A与tRNAIle竞争，同时与l-异亮氨酸或中间类似物Ile-AMS协同结合ScIleRS的氨酰化口袋。这项研究强调了I类氨酰-tRNA合成酶的罗斯曼折叠催化结构域的巨大tRNA结合位点可以被小分子靶向。这一发现将为未来的合理药物设计提供信息。
The polyketide natural product reveromycin A (RM-A) exhibits antifungal, anticancer, anti-bone metastasis, anti-periodontitis and anti-osteoporosis activities by selectively inhibiting eukaryotic cytoplasmic isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS). Herein, a co-crystal structure suggests that the RM-A molecule occupies the substrate tRNAIlebinding site ofSaccharomyces cerevisiaeIleRS (ScIleRS), by partially mimicking the binding of tRNAIle. RM-A binding is facilitated by the copurified intermediate product isoleucyl-adenylate (Ile-AMP). The binding assays confirm that RM-A competes with tRNAIlewhile binding synergistically withl-isoleucine or intermediate analogue Ile-AMS to the aminoacylation pocket ofScIleRS. This study highlights that the vast tRNA binding site of the Rossmann-fold catalytic domain of class I aminoacyl-tRNA synthetases could be targeted by a small molecule. This finding will inform future rational drug design.
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影响因子：
3.2
作者：
Fremlin, Leith;Farrugia, Michelle;Capon, Robert J.
通讯作者：
Capon, Robert J.
影响因子：
4.8
作者：
Miyamoto, Y;Machida, K;Miyakawa, T
通讯作者：
Miyakawa, T
影响因子：
16.6
作者：
Fang, Pengfei;Yu, Xue;Jeong, Seung Jae;Mirando, Adam;Chen, Kaige;Chen, Xin;Kim, Sunghoon;Francklyn, Christopher S.;Guo, Min
通讯作者：
Guo, Min
DOI：
10.1107/s0907444909042073
发表时间：
2010-01
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Chen VB;Arendall WB 3rd;Headd JJ;Keedy DA;Immormino RM;Kapral GJ;Murray LW;Richardson JS;Richardson DC
通讯作者：
Richardson DC
一类喹唑啉酮-苏氨酸杂化物作为抗菌 ThrRS 抑制剂的结构引导优化和机理研究
影响因子：
6.7
作者：
Guo, Junsong;Chen, Bingyi;Zhou, Huihao
通讯作者：
Zhou, Huihao