Cyclophilin A complexed with a fragment of HIV-1 gag protein: insights into HIV-1 infectious activity.
Cyclophilin A complexed with a fragment of HIV-1 gag protein: insights into HIV-1 infectious activity.
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亲环蛋白 A 与 HIV-1 gag 蛋白片段复合：深入了解 HIV-1 感染活性。
DOI：
10.1016/s0969-2126(97)00172-x
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发表时间：
1997
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ke,H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhao,Y;Chen,Y;Schutkowski,M;Fischer,G;Ke,H
背景：亲环素A（Cyclophilin A，CyPA）是免疫抑制剂环孢菌素A（cyclosporin A，CsA）的受体，催化肽基-脯氨酰键的顺式转异构化，是人类免疫缺陷病毒1型（human immunodeficiency virus type 1，HIV-1）感染活性所必需的。CyPA与HIV-1 gag蛋白片段复合的晶体结构应提供深入了解CyPA-gag相互作用的性质，并可能表明CyPA在HIV-1感染activity.Results中的作用：确定CyPA与HIV-1 gag衣壳蛋白的25个氨基酸肽（25-mer）复合的晶体结构，并在1.8 μ m分辨率下将其精修至R因子为0.195。gag片段的序列Ala 88-Gly 89-Pro 90-Ile 91是与CyPA活性位点结合的主要部分。25-mer的两个残基（Pro 90-Ile 91）以与CyPA底物琥珀酰-Ala-Ala-Pro-Phe-对硝基苯胺（AAPF）的两个残基（Pro-Phe）类似的方式结合CyPA。然而，25-mer（Ala 88-Gly 89）的N-末端表现出与AAPF不同的氢键模式和分子构象。25-mer的Gly 89和Pro 90之间的肽基-脯氨酰键具有反式构象，与在其他已知的CyPA-肽复合物中观察到的构象相反。结论：gag 25-mer片段中Gly 89的骨架构象不佳，提示HIV-1gag蛋白与CyPA的结合需要一个特殊的序列Gly-Pro。因此，在HIV-1感染性中，CyPA可能作为伴侣蛋白发挥作用，而不是作为酸式转异构酶发挥作用。然而，25-mer和底物AAPF的C末端之间的相似性的观察意味着不能完全排除CyPA的半胱氨酸-转氨酶活性的参与。
Background:Cyclophilin A (CyPA), a receptor of the immunosuppressive drug cyclosporin A, catalyzes thecis-transisomerization of peptidyl–prolyl bonds and is required for the infectious activity of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). The crystal structure of CyPA complexed with a fragment of the HIV-1 gag protein should provide insights into the nature of CyPA–gag interactions and may suggest a role for CyPA in HIV-1 infectious activity.Results:The crystal structure of CyPA complexed with a 25 amino acid peptide of HIV-1 gag capsid protein (25-mer) was determined and refined to an R factor of 0.195 at 1.8 Å resolution. The sequence Ala88-Gly89-Pro90-Ile91 of the gag fragment is the major portion to bind to the active site of CyPA. Two residues of the 25-mer (Pro90-Ile91) bind to CyPA in a similar manner to two residues (Pro-Phe) of the CyPA substrate, succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilide (AAPF). However, the N-terminus of the 25-mer (Ala88-Gly89) exhibits a different hydrogen-bonding pattern and molecular conformation than AAPF. The peptidyl–prolyl bond between Gly89 and Pro90 of the 25-mer has atransconformation, in contrast to thecisconformation observed in other known CyPA–peptide complexes. The residue preceding proline, Gly89, has an unfavorable backbone conformation usually only adopted by glycine.Conclusions:The unfavorable backbone conformation of Gly89 of the gag 25-mer fragment suggests that binding between HIV-1 gag protein and CyPA requires a special sequence, Gly-Pro. Thus, in HIV-1 infectivity, CyPA is likely to function as a chaperone, rather than as acis-transisomerase. However, the observation of similarities between the C termini of the 25-mer and the substrate AAPF means that the involvement of thecis-transisomerase activity of CyPA cannot be completely ruled out.
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DOI：
--
发表时间：
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--
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