SNIKT: sequence-independent adapter identification and removal in long-read shotgun sequencing data
SNIKT: sequence-independent adapter identification and removal in long-read shotgun sequencing data
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btac389
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发表时间：
2022-06-13
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Dickson, Robert P.
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Ranjan, Piyush;Brown, Christopher A.;Dickson, Robert P.
摘要：在这里，我们介绍SNIKT，一个命令行工具，用于全基因组鸟枪式或超基因组鸟枪式长读测序DNA或RNA数据中与序列无关的可视确认和输入辅助移除接头污染。
A Summary: Here, we introduce SNIKT, a command-line tool for sequence-independent visual confirmation and input-assisted removal of adapter contamination in whole-genome shotgun or metagenomic shotgun long-read sequencing DNA or RNA data.