Cross-enhancement of ANGPTL4 transcription by HIF1 alpha and PPAR beta/delta is the result of the conformational proximity of two response elements.
Cross-enhancement of ANGPTL4 transcription by HIF1 alpha and PPAR beta/delta is the result of the conformational proximity of two response elements.
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DOI：
10.1186/gb-2014-15-4-r63
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发表时间：
2014-04-10
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Wada Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Inoue T;Kohro T;Tanaka T;Kanki Y;Li G;Poh HM;Mimura I;Kobayashi M;Taguchi A;Maejima T;Suehiro J;Sugiyama A;Kaneki K;Aruga H;Dong S;Stevens JF;Yamamoto S;Tsutsumi S;Fujita T;Ruan X;Aburatani H;Nangaku M;Ruan Y;Kodama T;Wada Y
不同刺激物协同转录激活的报道伴随着一系列不同的机制，但这些机制的全部范围尚未阐明。我们对内皮细胞中依赖低氧诱导因子1的基因表达进行了详细的研究，这表明了过氧化体增殖物激活受体β/δ和低氧诱导因子信号轴之间的相互作用的重要性。迁移实验表明这两个刺激物之间存在协同作用，我们通过基因芯片和芯片序列分析相结合的方法确定了血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)是一个共同的靶基因。我们分析了在低氧、PPARβ/δ激动剂和双重刺激下增强子上组蛋白标记的变化，这表明两个反应元件的空间接近是协同转录诱导的主要原因。一种新发展的定量染色体构象捕获分析显示了这两个反应元件接近频率的定量变化。据我们所知，这是首次报道两种不同的转录因子通过它们共同的靶基因的构象变化以协同的方式进行转录调控。
Synergistic transcriptional activation by different stimuli has been reported along with a diverse array of mechanisms, but the full scope of these mechanisms has yet to be elucidated. We present a detailed investigation of hypoxia-inducible factor (HIF) 1 dependent gene expression in endothelial cells which suggests the importance of crosstalk between the peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) β/δ and HIF signaling axes. A migration assay shows a synergistic interaction between these two stimuli, and we identify angiopoietin-like 4 (ANGPTL4) as a common target gene by using a combination of microarray and ChIP-seq analysis. We profile changes of histone marks at enhancers under hypoxia, PPARβ/δ agonist and dual stimulations and these suggest that the spatial proximity of two response elements is the principal cause of the synergistic transcription induction. A newly developed quantitative chromosome conformation capture assay shows the quantitative change of the frequency of proximity of the two response elements. To the best of our knowledge, this is the first report that two different transcription factors cooperate in transcriptional regulation in a synergistic fashion through conformational change of their common target genes.
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作者：
通讯作者：
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