Identification of phagocytosis regulators using magnetic genome-wide CRISPR screens.
Identification of phagocytosis regulators using magnetic genome-wide CRISPR screens.
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DOI：
10.1038/s41588-018-0254-1
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发表时间：
2018-12
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Bassik MC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Haney MS;Bohlen CJ;Morgens DW;Ousey JA;Barkal AA;Tsui CK;Ego BK;Levin R;Kamber RA;Collins H;Tucker A;Li A;Vorselen D;Labitigan L;Crane E;Boyle E;Jiang L;Chan J;Rincón E;Greenleaf WJ;Li B;Snyder MP;Weissman IL;Theriot JA;Collins SR;Barres BA;Bassik MC
从病原体防御到组织动态平衡，吞噬作用是一系列生理功能所必需的，但吞噬不同底物所需的机制仍不完全清楚。在这里，我们开发了一种基于磁铁的快速表型筛选策略，并在人类细胞中进行了八次全基因组CRISPR筛选，以识别调节不同底物吞噬作用的基因。在聚焦小屏幕、正交试验和原代人类巨噬细胞中验证了选定的命中后，我们证明了1)先前未描述的基因NHLRC2是吞噬作用的中心角色，调节控制肌动蛋白聚合和丝状足突形成的RhoA-RAC1信号级联反应；2)超长链脂肪酸对于某些底物的有效吞噬是必不可少的；以及3)先前未描述的阿尔茨海默病相关基因TM2D3可以优先影响淀粉样蛋白-β聚集体的摄取。这些发现阐明了吞噬作用的新调节因子和核心原理，更广泛地建立了一种有效的方法，用于在不同的生理和病理背景下无偏见地识别细胞摄取机制。
Phagocytosis is required for a broad range of physiological functions, from pathogen defense to tissue homeostasis, but mechanisms required for phagocytosis of diverse substrates remain incompletely understood. Here, we develop a rapid magnet-based phenotypic screening strategy, and perform eight genome-wide CRISPR screens in human cells to identify genes regulating phagocytosis of distinct substrates. After validating select hits in focused mini-screens, orthogonal assays and primary human macrophages, we demonstrate that 1) the previously-uncharacterized gene NHLRC2 is a central player in phagocytosis, regulating RhoA-Rac1 signaling cascades that control actin polymerization and filopodia formation, 2) very long chain fatty acids are essential for efficient phagocytosis of certain substrates, and 3) the previously-uncharacterized Alzheimer’s disease-associated gene TM2D3 can preferentially influence uptake of amyloid-β aggregates. These findings illuminate new regulators and core principles of phagocytosis, and more generally establish an efficient method for unbiased identification of cellular uptake mechanisms across diverse physiological and pathological contexts.
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影响因子：
9.9
作者：
Collins SR;Yang HW;Bonger KM;Guignet EG;Wandless TJ;Meyer T
通讯作者：
Meyer T
影响因子：
4.5
作者：
Jakobsdottir J;van der Lee SJ;Bis JC;Chouraki V;Li-Kroeger D;Yamamoto S;Grove ML;Naj A;Vronskaya M;Salazar JL;DeStefano AL;Brody JA;Smith AV;Amin N;Sims R;Ibrahim-Verbaas CA;Choi SH;Satizabal CL;Lopez OL;Beiser A;Ikram MA;Garcia ME;Hayward C;Varga TV;Ripatti S;Franks PW;Hallmans G;Rolandsson O;Jansson JH;Porteous DJ;Salomaa V;Eiriksdottir G;Rice KM;Bellen HJ;Levy D;Uitterlinden AG;Emilsson V;Rotter JI;Aspelund T;Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology consortium;Alzheimer’s Disease Genetic Consortium;Genetic and Environmental Risk in Alzheimer’s Disease consortium;O'Donnell CJ;Fitzpatrick AL;Launer LJ;Hofman A;Wang LS;Williams J;Schellenberg GD;Boerwinkle E;Psaty BM;Seshadri S;Shulman JM;Gudnason V;van Duijn CM
通讯作者：
van Duijn CM
影响因子：
14.8
作者：
Dunkley, Peter R.;Jarvie, Paula E.;Robinson, Phillip J.
通讯作者：
Robinson, Phillip J.
影响因子：
4.8
作者：
Kajkowski, EM;Lo, CF;Ozenberger, BA
通讯作者：
Ozenberger, BA
DOI：
10.1073/pnas.0506182103
发表时间：
2006-01-17
影响因子：
11.1
作者：
Garver, LS;Wu, JL;Wu, LP
通讯作者：
Wu, LP