冬虫夏草 NADPH-细胞色素 P450 还原酶基因的生物信息学分析

冬虫夏草 NADPH-细胞色素 P450 还原酶基因的生物信息学分析
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DOI:
10.13341/j.jfr.2021.1378
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发表时间:
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期刊:
菌物研究
影响因子:
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通讯作者:
程舟
程舟
中科院分区:
其他
文献类型:
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作者:
徐子娴;朱云国;李珊;程舟

文献摘要

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细胞色素 P450 家族和真菌致病性有关,而细胞色素 P450 的催化活性又依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)-细胞色素 P450 还原酶(CPR)提供的电子。本研究扩增获得 2 个冬虫夏草 NADPH-CPR基因,利用生物信息学方法分析冬虫夏草 NADPH-CPR 基因序列特征及预测编码蛋白的理化性质和结构特征等。结果表明 2 个冬虫夏草 NADPH-CPR 基因的核苷酸序列长度分别为 2192 bp 和 3603 bp,编码 692和 1065 个氨基酸,对应 3 个外显子和 7 个外显子。2 个冬虫夏草 NADPH-CPR 均为亲水性蛋白,最可能分别定位于内质网的分泌途径和细胞质上,蛋白质二级结构原件为 α 螺旋、无规则卷曲、延伸链、β-转角,其中 NADPH-CPR-1 的 α 螺旋占比相对较少,无规则卷曲和延伸链占比增加。2 个冬虫夏草 NADPH-CPR均具有 NADPH-CPR 典型的结构域,而 NADPH-CPR-2 在 N 端多了一个细胞色素 P450 结构域。研究结果为进一步探讨 NADPH-CPR 基因多样性可能对冬虫夏草菌侵染寄主的影响打下基础。