The complete mitogenome of Smith's shrew (Chodsigoa smithii).
The complete mitogenome of Smith's shrew (Chodsigoa smithii).
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史密斯鼩鼱 (Chodsigoa smithii) 的完整线粒体基因组
DOI：
10.1080/23802359.2019.1640645
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发表时间：
2019-07-18
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Chen S
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Pu Y;Tan X;Wei H;Fu C;Chen S
史密斯鼩鼱（Chodsigoa smithii）属于鼩鼱亚科，是中国特有的鼩鼱。在这项研究中，我们获得了 C. smithii 的完整线粒体基因组。该线粒体基因组是一个环状分子，长度为17,108bp，含有13个蛋白编码基因，22个转移RNA基因，2个核糖体RNA基因，1个轻链复制起点（OL），1个非编码区，碱基组成为32.5%A，29.3%T，24.8%C，13.4%G。该丝裂基因组13个蛋白编码基因的核苷酸序列数据C. smithii 和其他 19 个 Soricomorpha 物种被用于系统发育分析。系统发育树显示 Soricinae 包括两个主要的系统发育谱系。 Chodsigoa smithii 位于 Nectogalini 部落的基础位置。
The Smith’s shrew (Chodsigoa smithii) belongs to subfamily Soricinae, which is an endemic shrew to China. In this study, we obtained the complete mitochondrial genome of the C. smithii. This mitogenome is a circular molecule with 17,108 bp in length, containing 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes, two ribosome RNA genes, one light strand replication origin (OL), one non-coding region, and with a base composition of 32.5% A, 29.3% T, 24.8% C, and 13.4% G. The nucleotide sequence data of 13 protein-coding genes of C. smithii and other 19 Soricomorpha species were used for phylogenetic analyses. Phylogenetic tree shows that Soricinae includes two major phylogenetic lineages. Chodsigoa smithii is located as a basal position in tribe Nectogalini.
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