3D-Fluorescence In Situ Hybridization of Intact, Anaerobic Biofilm
3D-Fluorescence In Situ Hybridization of Intact, Anaerobic Biofilm
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DOI：
10.1007/978-1-4939-0554-6_13
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发表时间：
2014-01-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Fields, Matthew W.
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Brileya, Kristen A.;Camilleri, Laura B.;Fields, Matthew W.
FISH（荧光原位杂交）是一种有价值的技术，可以可视化和量化生物膜内不同微生物物种的定位。在典型的 FISH 样品制备过程中，生物膜构象可能会发生变化，这可能会影响多物种生物膜的观察，包括细胞的相对位置。在这里，我们描述了在 FISH 过程中保留 3-D 结构的方法，以可视化普通脱硫弧菌 Hildenborough 和马里帕鲁迪斯甲烷球菌的厌氧共培养生物膜
FISH (fluorescence in situ hybridization) is a valuable technique to visualize and quantify localization of different microbial species within biofilms. Biofilm conformation can be altered during typical sample preparation for FISH, which can impact observations in multispecies biofilms, including the relative positions of cells. Here, we describe methods to preserve 3-D structure during FISH for visualization of an anaerobic coculture biofilm of Desulfovibrio vulgaris Hildenborough and Methanococcus maripaludis