嫁接番茄长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定
嫁接番茄长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定
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DOI：
10.13271/j.mpb.019.001072
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发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
张杰
中科院分区：
文献类型：
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作者：
杜康华;王光;赵重燕;张宏;李作森;杨正安;张杰
嫁接是重要的农业栽培措施之一,具有增加产量、提高抗性、改善品质等作用。目前对植物嫁接的分子机理研究已经拓展到RNA水平,但主要集中在mRNA和小RNA上,而对长链非编码RNA (lncRNA)的研究还不多见。本研究对公共数据库中嫁接番茄转录组数据进行分析,分别在接穗(番茄)和砧木(马铃薯)中鉴定出3 360和5 657个物种特异lncRNA,其中有298和847个lncRNA差异表达,9个lncRNA可在接穗和砧木间移动。进一步分析表明,lncRNA的移动机制与相对表达丰度没有明显关联,lncRNA具有调控嫁接植株代谢过程和花期的潜在作用。本研究结果为嫁接番茄lncRNA的鉴定和功能预测提供理论依据。