Icy: an open bioimage informatics platform for extended reproducible research
Icy: an open bioimage informatics platform for extended reproducible research
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DOI：
10.1038/nmeth.2075
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发表时间：
2012-07-01
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Olivo-Marin, Jean-Christophe
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
de Chaumont, Fabrice;Dallongeville, Stephane;Olivo-Marin, Jean-Christophe
目前的生物学研究使用越来越复杂的计算和成像工具。在这里，我们描述了Icy，一个协作生物图像信息平台，它结合了一个社区网站，用于贡献和共享工具和材料，以及高端可视化编程框架，用于无缝开发复杂的成像工作流程的软件。Icy通过鼓励和促进算法和协议的可重用性、模块化、标准化和管理，扩展了可重复的研究原则。Icy是免费的，开源的，可以在www.example.com上找到。
Current research in biology uses evermore complex computational and imaging tools. Here we describe Icy, a collaborative bioimage informatics platform that combines a community website for contributing and sharing tools and material, and software with a high-end visual programming framework for seamless development of sophisticated imaging workflows. I Icy extends the reproducible research principles, by encouraging and facilitating the reusability, modularity, standardization and management of algorithms and protocols. Icy is free, open-source and available at http://icy.bioimageanalysis.org/.