mirAct: a web tool for evaluating microRNA activity based on gene expression data.

mirAct: a web tool for evaluating microRNA activity based on gene expression data.
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mirAct:基于基因表达数据评估 microRNA 活性的网络工具

DOI:
10.1093/nar/gkr351
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发表时间:
2011-07
影响因子:
14.9
通讯作者:
Wu J
Wu J
中科院分区:
生物学2区
文献类型:
--
作者:
Liang Z;Zhou H;He Z;Zheng H;Wu J

文献摘要

参考文献

被引文献

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MicroRNA (miRNA) 是复杂细胞网络中的关键调节因子。 mirAct网络服务器(http://sysbio.ustc.edu.cn/software/mirAct)是一个基于基因表达数据、利用miRNA与其靶基因之间的负调控关系来研究miRNA活性的工具。 mirAct 支持多类数据,并能够根据计算确定的 miRNA 活性进行聚类分析。在这里,我们描述了 mirAct 的框架,通过与其他类似程序进行比较来展示其性能,并通过案例研究来举例说明其应用。
MicroRNAs (miRNAs) are critical regulators in the complex cellular networks. The mirAct web server (http://sysbio.ustc.edu.cn/software/mirAct) is a tool designed to investigate miRNA activity based on gene-expression data by using the negative regulation relationship between miRNAs and their target genes. mirAct supports multiple-class data and enables clustering analysis based on computationally determined miRNA activity. Here, we describe the framework of mirAct, demonstrate its performance by comparing with other similar programs and exemplify its applications using case studies.
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