A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes.
A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes.
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DOI：
10.1038/s41586-018-0393-7
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发表时间：
2018-08
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Rajagopal J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Montoro DT;Haber AL;Biton M;Vinarsky V;Lin B;Birket SE;Yuan F;Chen S;Leung HM;Villoria J;Rogel N;Burgin G;Tsankov AM;Waghray A;Slyper M;Waldman J;Nguyen L;Dionne D;Rozenblatt-Rosen O;Tata PR;Mou H;Shivaraju M;Bihler H;Mense M;Tearney GJ;Rowe SM;Engelhardt JF;Regev A;Rajagopal J
我们结合单细胞RNA-SEQ和体内谱系追踪来研究小鼠气管上皮的细胞组成和层级。我们确定了一种新的罕见细胞类型，FoxI1阳性的肺离子细胞；基于其近端位置的俱乐部细胞的功能变异；位于高周转率鳞状上皮结构中的一种独特的细胞类型，我们将其命名为“丘状”；以及与疾病相关的簇状细胞和杯状细胞亚群。通过一种名为Pulse-Seq的新方法，我们证明了丛状细胞、神经内分泌细胞和离子细胞是由基础祖细胞持续和直接补充的。值得注意的是，囊性纤维化基因cftr主要在小鼠和人的肺离子细胞中表达。Foxi1在小鼠离子细胞中的丢失会导致CFTR表达的丧失，并破坏气道液和粘液生理，这在囊性纤维化中也会发生改变。通过将细胞类型特异性表达程序与关键疾病基因联系起来，我们建立了一种新的呼吸道疾病的细胞叙事。
We combine single-cell RNA-seq and in vivo lineage tracing to study the cellular composition and hierarchy of the murine tracheal epithelium. We identify a new rare cell type, the FoxI1-positive pulmonary ionocyte; functional variations in club cells based on their proximodistal location; a distinct cell type that resides in high turnover squamous epithelial structures that we named “hillocks”; and disease-relevant subsets of tuft and goblet cells. With a new method, Pulse-Seq, we show that tuft, neuroendocrine, and ionocyte cells are continually and directly replenished by basal progenitor cells. Remarkably, the cystic fibrosis gene, CFTR, is predominantly expressed in the pulmonary ionocytes of both mouse and human. Foxi1 loss in murine ionocytes causes a loss of Cftr expression and disrupts airway fluid and mucus physiology, which are also altered in cystic fibrosis. By associating cell type-specific expression programs with key disease genes, we establish a new cellular narrative for airways disease.
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影响因子：
64.8
作者：
Konermann S;Brigham MD;Trevino AE;Joung J;Abudayyeh OO;Barcena C;Hsu PD;Habib N;Gootenberg JS;Nishimasu H;Nureki O;Zhang F
通讯作者：
Zhang F
DOI：
10.1126/science.1255825
发表时间：
2014-08-15
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Hoegger MJ;Fischer AJ;McMenimen JD;Ostedgaard LS;Tucker AJ;Awadalla MA;Moninger TO;Michalski AS;Hoffman EA;Zabner J;Stoltz DA;Welsh MJ
通讯作者：
Welsh MJ
影响因子：
30.5
作者：
Bansal, Geetanjali;Xie, Zhihui;Druey, Kirk M.
通讯作者：
Druey, Kirk M.
影响因子：
8
作者：
Birket, Susan E.;Davis, Joy M.;Rowe, Steven M.
通讯作者：
Rowe, Steven M.
DOI：
10.1164/rccm.201404-0670oc
发表时间：
2014-08-15
影响因子：
24.7
作者：
Birket, Susan E.;Chu, Kengyeh K.;Rowe, Steven M.
通讯作者：
Rowe, Steven M.