云南省不同感染来源间日疟原虫环子孢子蛋白基因多态和种群结构分析
云南省不同感染来源间日疟原虫环子孢子蛋白基因多态和种群结构分析
复制标题
DOI：
10.12140/j.issn.1000-7423.2020.01.010
复制
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
江陆斌
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
徐艳春;董莹;邓艳;毛祥华;陈梦妮;张苍林;江陆斌
目的分析云南省不同感染来源间日疟原虫环子孢子蛋白(Pvcsp)基因序列,揭示当地Pvcsp基因的种群结构和遗传多样性。方法收集中国疾病预防控制中心传染病网络直报系统中2014-2017年报告的云南省本地和输入性间日疟病例流行病学资料及血样。提取血样中疟原虫基因组DNA,巢式PCR扩增并测序。采用MEGA 5.04、Arlequin 3.5.2.2软件进行单倍型、期望杂合度(He)分析, DnaSP 5.10计算核苷酸多样性(π)、同义置换率(Ks) 、错义置换率(Ka)及群体间遗传分化指数(Fst) 。结果共检测间日疟病例血样969份,扩增获得650~750 bp大小的目的条带759份,包括云南本地感染者血样39份、非洲16份、缅甸688份、老挝13份、柬埔寨2份、巴基斯坦1份。单倍型分析结果显示, 759条Pvcsp基因序列存在90个单倍型,其中29个为PV-Ⅰ型温带族(类似VK210型), 50个为PV-Ⅰ型热带族(类似VK210型), 11个为PV-Ⅱ型(类似VK247型); 3种基因型所占比例分别为51.4%(390/759)、41.1%(312/759)、7.5%(57/759),分布于云南本地感染、缅甸输入性病例中,但非洲、老挝及其他地区的输入性病例只表现为PV-Ⅰ型。PV-Ⅰ型、PV-Ⅱ型氨基酸序列突变分别发生在29、10个位点。759份病例血样的He为0.224, π为0.075, Ka/Ks为0.48。除去柬埔寨和巴基斯坦, Pvcsp基因在老挝输入性病例中的遗传多样性最高(He = 0.422, π = 0.03),云南本地与非洲输入性病例中的遗传分化最高(Fst = 0.082),与缅甸输入性病例的遗传分化最低(Fst = 0.002); Pvcsp基因在非洲与东南亚地区输入病例中属中等程度的遗传分化,在东南亚地区输入病例中遗传分化很小。结论云南省不同感染来源间日疟原虫环子孢子蛋白基因存在3种基因型,以PV-Ⅰ型温带族为优势虫株,不同基因型的种群结构和遗传分化不同。